Генетики проанализировали ДНК, секвенированную ими из останков девяти человек, захоронения которых раскопали в Бразилии в некрополе XVII века нашей эры. Исследователи подтвердили первоначальные догадки о том, что в обнаруженных могилах покоились останки молодых мужчин европейского происхождения, которые, похоже, погибли во время эпидемии. Как сообщается в препринте, выложенном на сайте bioRxiv.org, в останках как минимум трех человек сохранилась ДНК возбудителей пневмонии и туберкулеза.
С 1630 по 1654 год на землях современной Бразилии существовала голландская колония, центр которой располагался в городе Маурицстад, территория которого сегодня представляет собой часть крупного города Ресифи (штат Пернамбуку). В 2014 году в исторической части Ресифи строители наткнулись на старинный некрополь, располагавшийся под фундаментами зданий. Затем последовали археологические исследования открытого памятника, в ходе которых специалисты обнаружили погребения более 130 человек. Одна часть найденных могил представляла собой регулярные захоронения, в то время как другая часть относилась к какому-то трагическому событию (вероятно, эпидемии), в ходе которого людей пришлось быстро захоронить в наспех вырытых неглубоких ямах.
Предварительный биоархеологический анализ останков показал, что во время упомянутого события умерли молодые люди в возрасте от 15 до 21 года, причем на их останках нет признаков того, что смерть была насильственной. Исследователи предположили, что, возможно, погибшие были новобранцами из Европы или работниками Голландской Вест-Индской компании. Чтобы проверить гипотезу о происхождении этих индивидов и попытаться определить потенциальные причины их смерти, группа ученых из Бразилии и США во главе с Ракель Ассис (Raquel Assis) из Флоридского атлантического университета в Бока-Ратоне отобрала образцы останков девяти человек, из которых затем они успешно выделили ДНК.
Исследователи определили, что все останки принадлежали мужчинам, большинство которых были носителями отцовских линий, относящихся к Y-хромосомным гаплогруппам R1a и R1b, которые распространены в европейских популяциях. Только один человек оказался носителем Y-хромосомной гаплогруппы A-Y156117, распространенной в восточноафриканских популяциях, однако дальнейший анализ аутосомного генома не выявил у этого индивида заметной африканской примеси. Кроме того, последовательность Y-хромосомы еще одного мужчины ученые прочитали достаточно плохо, чтобы определить потенциальный регион, из которого она происходила.
Дальнейшие исследования показали, что генетически все проанализированные индивиды близки к популяциям из Западной Евразии, особенно — из Европы. В частности, три генома, которые ученые прочитали лучше всего, оказались близки к популяциям из Исландии, Норвегии, Эстонии, Чехии, Словакии и некоторым другим. Скрининг ДНК, секвенированной из этих образцов, показал, что в них присутствует генетический материал патогенных бактерий: во-первых, клебсиеллы пневмонии (Klebsiella pneumoniae) — возбудителя пневмонии, сепсиса и прочих тяжелых заболеваний, во-вторых, палочки Коха (Mycobacterium tuberculosis) — возбудителя туберкулеза. Учитывая наличие этих патогенов, ученые заключили, что, вероятно, раскопанные останки связаны с эпидемией, которая вспыхнула в XVII веке.
Генетические методы дают все больше информации о том, с какими инфекциями сталкивались различные древние и средневековые популяции. Например, ученые выяснили, что первобытные люди больше пяти тысяч лет назад уже страдали от чумной палочки (Yersinia pestis), о чем говорят находки из Прибайкалья, Прибалтики, Скандинавии и Центральной Европы.