Первое дошедшее до нас упоминание о Заиконоспасском монастыре относится к 1600 году. Однако, согласно так называемому Петровскому плану Москвы («Петров чертеж»), датируемому 1597–1599 годами, на площади, занимаемой монастырем, уже тогда стояли два храма. При проведении в 1990 годах реставрационных работ здесь была обнаружена кладка белокаменного фундамента конца XVI века, что дает основание предположить существование на этом месте более древних храмовых построек.
Улица, на которой находится монастырь, получила название от Никольского монастыря, основанного в XIV столетии. Поэтому обитель первоначально именовалась «Спасской, что на Никольском крестце».
Справочник «Православная Москва» сообщает, что Заиконоспасский монастырь основал царь Борис Годунов. Но Смута, повергнувшая Московское государство в страшное разорение, на много лет отодвинула обустройство новой обители. Лишь при царе Михаиле Федоровиче монастырь был возобновлен на «старом месте, в песках, за иконным рядом». Торговые ряды