Найти в Дзене

С точки зрения биоинформатики: ВИЧ. Часть 1. История и хроника распространения ВИЧ в России и мире.

История эпидемии, изменившей мир, началась с короткой заметки, опубликованной 5 июня 1981 года в специализированном издании MMWR (Morbidity and Mortality Weekly Report) — еженедельном отчете Центров по контролю и профилактике заболеваний США (CDC). Пневмоцистная пневмония в Лос-Анджелесе.В период с октября 1980 по май 1981 года у пятерых молодых, ранее здоровых мужчин, являющихся активными гомосексуалистами, в разных больницах Лос-Анджелеса был лабораторно подтвержден случай пневмоцистной пневмонии. Двое из них скончались. Это была первая официальная публикация о том, что позже назовут СПИДом. Тревогу врачей вызвало то, что пневмоцистная пневмония, вызываемая дрожжеподобным грибом Pneumocystis carinii (jirovecii), обычно поражает только людей с сильно ослабленным иммунитетом. Здесь же речь шла о молодых и прежде здоровых мужчинах. Это указывало на появление нового, неизвестного фактора, разрушающего иммунную систему. Такие инфекции называют оппортунистическими. Оппортунистические ин
Оглавление

Первые сигналы: загадочная болезнь в США

История эпидемии, изменившей мир, началась с короткой заметки, опубликованной 5 июня 1981 года в специализированном издании MMWR (Morbidity and Mortality Weekly Report) — еженедельном отчете Центров по контролю и профилактике заболеваний США (CDC).

Пневмоцистная пневмония в Лос-Анджелесе.В период с октября 1980 по май 1981 года у пятерых молодых, ранее здоровых мужчин, являющихся активными гомосексуалистами, в разных больницах Лос-Анджелеса был лабораторно подтвержден случай пневмоцистной пневмонии. Двое из них скончались.

Скан-копия Morbidity and Mortality Weekly Report от 5 июня 1981 года
Скан-копия Morbidity and Mortality Weekly Report от 5 июня 1981 года

Это была первая официальная публикация о том, что позже назовут СПИДом. Тревогу врачей вызвало то, что пневмоцистная пневмония, вызываемая дрожжеподобным грибом Pneumocystis carinii (jirovecii), обычно поражает только людей с сильно ослабленным иммунитетом. Здесь же речь шла о молодых и прежде здоровых мужчинах. Это указывало на появление нового, неизвестного фактора, разрушающего иммунную систему. Такие инфекции называют оппортунистическими.

Оппортунистические инфекции (от лат. opportunus — удобный) — это заболевания, вызываемые условно-патогенными микроорганизмами (вирусами, бактериями, грибами), которые не приводят к болезни у людей с нормальной иммунной системой, но становятся опасными при иммунодефиците.

Публикация вызвала шквал сообщений о похожих случаях из Нью-Йорка, Сан-Франциско и других городов. Вскоре, 3 июля 1981 года в том же MMWR вышла новая заметка: «Саркома Капоши и пневмоцистная пневмония среди гомосексуалистов Нью-Йорка и Калифорнии».

Скан-копия Morbidity and Mortality Weekly Report от 3 июля 1981 года
Скан-копия Morbidity and Mortality Weekly Report от 3 июля 1981 года

Врачи столкнулись со вспышкой саркомы Капоши — редкого вида рака, который до этого встречался в основном у пожилых мужчин. Теперь он агрессивно поражал молодых людей, и часто — в сочетании с уже описанной ранее пневмоцистной пневмонией.

Фотография пациента с поражениями, характерными для Саркомы Капоши.
Фотография пациента с поражениями, характерными для Саркомы Капоши.

В тот же день 3 июля 1981 года газета The New York Times выпустила статью «Редкий вид рака обнаружен у 41 гомосексуалиста» (Rare Cancer Seen in 41 Homosexuals). Автор, Лоуренс Альтман, писал: «Причина вспышки заболевания остаётся неизвестной». Болезнь получила неофициальное название «гей-рак» (gay cancer), что породило волну стигматизации. Активисты гей-сообществ начали проводить пикеты, требуя от властей признать угрозу и выделить средства на исследования. Этот момент ознаменовал выход истории из узкоспециализированных медицинских бюллетеней в широкое общественное пространство

Скан-копия газеты The New York Times за 3 июля 1981 года.
Скан-копия газеты The New York Times за 3 июля 1981 года.

В июле 1982 года для нового заболевания был предложен официальный термин — AIDS (Acquired Immune Deficiency Syndrome), или СПИД (синдром приобретенного иммунодефицита).

Гонка за вирусом: открытие ВИЧ

История открытия вируса, вызывающего СПИД, — это не только триумф науки, но и драматическая история о соперничестве, амбициях и политике.

С самого начала ученые подозревали, что причиной болезни является вирус. Лаборатории по всему миру вступили в гонку за его обнаружение. Прорыв произошел в 1983 году. Две команды, работавшие независимо друг от друга, выделили новый ретровирус из тканей пациентов:

  • В Институте Пастера (Франция) под руководством Люка Монтанье и Франсуазы Барре-Синусси. Они назвали вирус LAV (lymphadenopathy-associated virus, вирус, ассоциированный с лимфаденопатией).
  • В Национальном институте рака (США) под руководством Роберта Галло. Его команда назвала вирус HTLV-III, ошибочно связав его с ранее изученными им вирусами Т-клеточного лейкоза человека.

В 1986 году было доказано, что оба вируса генетически идентичны. Международный комитет по таксономии вирусов присвоил ему единое название — вирус иммунодефицита человека (ВИЧ). В 2008 году Люк Монтанье и Франсуаза Барре-Синусси получили Нобелевскую премию «за открытие вируса иммунодефицита человека».

На фото: король Швеции Карл XVI Густав вручает Нобелевскую премию Франсуазе Барре-Синусси (2008 год)
На фото: король Швеции Карл XVI Густав вручает Нобелевскую премию Франсуазе Барре-Синусси (2008 год)

Спор между Галло и Монтанье был не просто академической ссорой из-за признания. Он имел серьезные реальные последствия, влияя на международные отношения, патентные права на первые тест-системы для крови и, возможно, задерживая совместные исследования на критически раннем этапе эпидемии. Открытие вируса было не только научным, но и коммерческим прорывом, поскольку позволило разработать первые диагностические тесты. Спор о приоритете, таким образом, был и спором о ценных патентах, что привело к судебным искам между Институтом Пастера и правительством США.

Конфликт обострился до такой степени, что потребовалось вмешательство президента США Рональда Рейгана и премьер-министра Франции Жака Ширака для заключения соглашения в 1987 году. Этот конфликт на высшем уровне между двумя ведущими научными державами мира подчеркивает огромное давление и конкуренцию, которые характеризовали гонку за понимание СПИДа.

В поисках лекарства: от отчаяния к надежде

Тем временем эпидемия разрасталась. Первые годы были самыми драматичными: с 1981 по 1987 год не существовало никакой терапии, способной остановить развитие СПИДа. Этот мрачный период отражен в фильме «Давний компаньон» (1990).

Кадр из фильма «Давний компаньон» (1990). Один из героев читает как раз ту самую статью Лоуренса Альтмана в New York Times
Кадр из фильма «Давний компаньон» (1990). Один из героев читает как раз ту самую статью Лоуренса Альтмана в New York Times

1987: Первый препарат — Зидовудин (АЗТ)

Азидотимидин (АЗТ) был синтезирован еще в 1960-х как лекарство от рака, но оказался неэффективен. В 1984 году исследователи из Wellcome Research Laboratories обнаружили, что он подавляет репликацию ВИЧ. В 1987 году Зидовудин (торговая марка АЗТ) стал первым антиретровирусным препаратом, одобренным к применению.

На фото: Азидотимидин
На фото: Азидотимидин

Однако у АЗТ вскоре обнаружилась серьезная проблема. ВИЧ обладает чрезвычайно высокой скоростью мутаций, что позволяет ему быстро приспосабливаться к лекарствам. Монотерапия одним лишь АЗТ давала лишь временную отсрочку, но не спасала от перехода к стадии СПИДа и смерти пациента. Яркий пример — смерть Фредди Меркьюри в 1991 году, которая показала миру, что одного препарата для победы над эпидемией недостаточно.

1991: Смерть Freddie Mercury

Смерть Freddie Mercury, показывающая что лечение одним только Зидовудином не может решить проблему. Общее количество погибших от ВИЧ к этому времени уже составило 431 тысячу человек.

Freddie Mercury на благотворительном концерте Live Aid (1985)
Freddie Mercury на благотворительном концерте Live Aid (1985)

Поиск других подходов к лечению ВИЧ инфекции продолжился.

1996 – наше время: Эра комбинированной терапии

Настоящий переворот в лечении ВИЧ произошел в середине 1990-х с появлением новых классов препаратов и разработкой высокоактивной антиретровирусной терапии (ВААРТ). Суть ВААРТ — в одновременном применении нескольких препаратов, которые блокируют разные этапы жизненного цикла вируса. Это не дает ВИЧ выработать устойчивость.

Ключевые классы препаратов:

  • Нуклеозидные ингибиторы обратной транскриптазы (НИОТ): К ним относится АЗТ. Мешают вирусу создавать ДНК-копию своего генома.
  • Ингибиторы протеазы (ИП): (ритонавир, 1996) — блокируют фермент, который «нарезает» вирусные белки для сборки новых вирионов.
  • Ингибиторы интегразы (ИИ): (ралтегравир, 2007) — не дают вирусной ДНК встроиться в геном клетки-хозяина.
  • Ингибиторы прикрепления: (фостемсавир, 2020) — мешают вирусу присоединиться к иммунной клетке (Т-лимфоциту).
  • Ингибиторы капсида: (ленакапавир, 2022) — нарушают сборку и разборку вирусной оболочки. Ленакапавир стал революционным препаратом длительного действия: его вводят в виде инъекции всего два раза в год.

Современные схемы терапии, такие как Truvada, объединяют несколько препаратов в одной таблетке, что значительно упрощает лечение и профилактику.

О механизмах действия этих препаратов мы подробно поговорим во второй части цикла.

ВИЧ в СССР и России: путь отрицания и запоздалого признания

В СССР первые случаи ВИЧ также были зафиксированы в 1980-х. «Нулевым пациентом» принято считать военного переводчика, работавшего в Африке. Официальная реакция властей была предсказуемой для того времени — отрицание. Министр здравоохранения РСФСР Николай Трубилин в 1986 году заявлял:

«В Америке СПИД бушует с 1981 года, это западная болезнь. У нас нет базы для распространения этой инфекции, так как в России нет наркомании и проституции».

В прессе продвигалась конспирологическая теория о том, что СПИД разработан в лабораториях ЦРУ. Существует даже версия, что привычная нам аббревиатура СПИД вместо более логичной СПИН (синдром приобретенной иммунной недостаточности) была принята, чтобы дистанцироваться от мировой проблемы.

Скан-копия газеты «Литературная газета» с материалом Валентина Запевалова «Паника на Западе, или что скрывается за сенсацией вокруг AIDS»
Скан-копия газеты «Литературная газета» с материалом Валентина Запевалова «Паника на Западе, или что скрывается за сенсацией вокруг AIDS»

Трагедия в Элисте в 1988-1989 годах, где из-за использования нестерильных медицинских инструментов в детской больнице были заражены 75 детей и 4 женщины, заставила признать проблему на государственном уровне. Последующий генетический анализ показал, что все они были инфицированы подтипом G, распространенным в Центральной Африке. Эти события легли в основу сериала «Нулевой пациент» (2022).

Постер к сериалу "Нулевой пациент" (2022)
Постер к сериалу "Нулевой пациент" (2022)

В 1990-е годы, после распада СССР, эпидемия ВИЧ в России начала стремительно расти, в первую очередь за счет распространения инъекционных наркотиков. Попав в эту среду, вирус вызвал взрывной рост заболеваемости в регионах с высоким уровнем наркомании (например, Свердловская и Кемеровская области). В 2000-е вирус вышел за пределы «групп риска» и начал активно распространяться половым путем среди всего населения.

По некоторым данным, опубликованным в авторитетных научных журналах, таких как PLoS One, реальное число людей, живущих с ВИЧ в России, может достигать 2 миллионов человек, что создает серьезную угрозу для демографии и общественного здоровья страны.

Новая «черная смерть»?

История знает пандемии, опустошавшие целые города. В XIV веке Сиена была одним из богатейших городов Европы, но эпидемия чумы («черная смерть») в 1348 году унесла жизни двух третей ее населения, навсегда остановив развитие города. Летописец Аньоло ди Тура, похоронивший в ту эпидемию пятерых своих детей, писал: «Все верили, что это конец света».

Изображение фрески "Аллегория доброго правления", автор Амброджо Лоренцетти. Изображена сцена процветающего города Сиенна, Италия за несколько лет до эпидемии чумы.
Изображение фрески "Аллегория доброго правления", автор Амброджо Лоренцетти. Изображена сцена процветающего города Сиенна, Италия за несколько лет до эпидемии чумы.

Сегодня нам кажется, что такие бедствия остались в прошлом. Но ВИЧ стал для нашего времени новой пандемией. Это враг, с которым борются тысячи ученых по всему миру. И биоинформатика — одно из самых мощных орудий в этой борьбе.

Во второй части мы ближе познакомимся с молекулярной биологией ВИЧ, а в третьей — рассмотрим, как биоинформатические инструменты помогают определять устойчивость вируса к лекарствам, что является ключевой задачей для современной медицины.