Актёрская карьера Кирилла Запорожского началась в 2005 году с дебюта в сериале «Полнолуние». Однако в первые несколько лет ему в основном доставались эпизодические роли, хотя и были некоторые заметные роли более заметные работы, например, роль Василия Шибанова в историческом телефильме «Иван Грозный», Костик в сериале «Русский шоколад» и Андрей Михайлов в сериале «Пыльная работа». Ситуация изменилась в 2011 году, когда Кирилл сыграл главную роль в драме «Неистовый, яростный, бешеный…» о совместной борьбе СССР и США с фашистами во время Второй Мировой войны. Но настоящую широкую известность молодому актёру принёс сериал «Ангел или демон», где он сыграл роль падшего ангела Дэна, которому велено совратить девушку кристально чистой души — Машу. После этого последовала целая серия крупных ролей в различных проектах — «Берега», «Второй шанс», «Мелодия на два голоса», «Взгляд из вечности», «Дом с лилиями», «Любимые женщины Казановы» и других. Отметился актёр и в известном сериале «Пока станица спит» — сыграл родственника Колеванова. А в 2017 году появится в одной из серий «Доктора Рихтера» (адаптации культового американского сериала «Доктор Хаус»). Одни из последних работ Кирилла — в мелодрамах «Охота на верного», «Нетающий лёд», «На пороге любви» и «Запретная любовь». За первые годы своей карьеры Кирилл сыграл множество ярких и запоминающихся ролей, постепенно завоёвывая всё большую популярность у зрителей.
Кирилл пополнил каст актёров в исторической драме «Тобол», режиссёром стал Игорь Зайцев. В 2015 году Кирилл снялся в киноленте Ильи Казакова «Петля Нестерова». Ему досталась роль молодого и неопытного участкового, а его отцу — мудрого по жизни следователя. В сериале так же снялись Оксана Акиньшина, Ирина Пегова и Сергей Горобченко.
В 2017 году Кирилл Запорожский снялся в научно-фантастическом приключенческом фильме «Притяжение» Фёдора Бондарчука. Актёр получил роль помощника полковника Лебедева (Олег Меньшиков). Высокие кассовые сборы и положительные оценки критиков подтвердили, что проект удался. В ноябре 2018-го завершились съёмки исторического фильма с участием Запорожского «Подольские курсанты». Проект был посвящён обороне Москвы юными курсантами военных училищ в 1941 году. Продюсер Игорь Угольников приступил к съёмкам после того, как Министерство обороны России сняло гриф секретности с документов о той операции.
В 2022 году с участием актёра состоялись премьеры двух увлекательных лент. В мини-сериале «Женщина с котом и детективом» ему довелось работать под началом женщины-режиссёра Татьяны Микрюковой. А в драме «Тверская», созданной для телеканала НТВ, на площадке Запорожский соседствовал с Иваном Колесниковым, Игорем Филипповым и Александром Красовским.
В феврале 2024-го актёр вместе с братом Макаром появились в эфире шоу «Сегодня вечером». Кирилл признался, что некогда завидовал успешности младшего родственника, но сейчас это чувство сменилось радостью.