После кончины императора Карла IV Люксембургского преемственность трона Священной Римской империи и Чешского королевства оказалась под вопросом. В Моравии в тот период совместно правили сыновья влиятельного маркграфа Яна Йиндржиха Люксембургского, а именно братья Йошт и Прокоп Люксембургские. Они активно поддерживали усилия Люксембургов по приобретению польской и венгерской корон, оказывая, в частности, финансовую помощь своему двоюродному брату Сигизмунду в его стремлении к венгерскому трону. Чешский король Вацлав IV также неоднократно обращался к своим моравским родственникам за финансовой поддержкой.
Первая маркграфская война ознаменовала собой начало борьбы за власть внутри династии Люксембургов после периода относительного спокойствия в 1380-х годах. Сигизмунд и Йошт противостояли Вацлаву IV, который искал поддержки у своего младшего брата Яна Згожелецкого и двоюродного брата Прокопа Моравского. В Моравии совместное правление Йошта и Прокопа прекратилось, перейдя в локальный конфликт за единоличную власть.
Во время второй маркграфской войны большинство моравских феодалов поддержали Йошта, но требовали плату за свою лояльность, фактически действуя как наемники. Прокоп нашёл союзников в северной Моравии и Силезии. Боевые действия перемежались с безуспешными мирными переговорами, что привело к безвластию в Моравии. Дворяне стали разбойниками, нападая на замки, деревни и купеческие обозы, захватывая заложников с целью получения выкупа.
В 1394 году Вацлав IV был пленен Йоштом и отправлен в Австрию, но освобожден через два года. Его брат Ян Згорелецкий также был освобожден, но вскоре умер при невыясненных обстоятельствах, оставив Прокопа Моравского главным союзником Вацлава. После смерти епископа Оломоуца Микулаша, Прокоп получил контроль над местными епископскими владениями, которые стали опорой власти Вацлава. Однако Папа Римский расценил это как захват церковных земель и пригрозил отлучением Прокопу и его сторонникам, включая Яна Сокола из Ламберка. Военные действия и грабежи продолжались.
Третья маркграфская война началась в 1402 году с пленения Вацлава IV Сигизмундом и последующего пленения Прокопа. Однако Йошт изменил свою политику, поссорился с Сигизмундом и заявил о своих претензиях на Богемию, сблизившись со сторонниками Вацлава и оппозицией Сигизмунду в Венгрии. В 1403 году в Венгрии вспыхнуло восстание, вынудив Сигизмунда и Альбрехта Австрийского покинуть Моравию.
Вацлав IV бежал из плена в Вене и возобновил войну против Сигизмунда. Решающее сражение состоялось летом 1404 года в Зноймо, где город, обороняемый Яном Соколом из Ламберка и Гинеком Сущим Дьяволом из Кунштата, был осажден войсками Сигизмунда и Альбрехта. Осада была снята через два месяца из-за дизентерии, поразившей Сигизмунда и Альбрехта, последний из которых скончался.
Прокоп был освобожден из тюрьмы в Брно, но вскоре, 4 сентября 1405 года, умер от последствий тюремного заключения, примирившись с Йоштом. После смерти Прокопа Йошт стал единоличным правителем Моравии и расширял свою власть, стремясь сравниться с Вацлавом IV и Сигизмундом Люксембургским. В конце 1410 года он стал королем Германии, но умер в январе 1411 года. Поскольку у Йошта и Прокопа не было наследников, титул маркграфа Моравии был передан Вацлаву IV, который включил маркграфство в состав Чешского королевства, подтвердив автономию моравов и назначив губернатора провинции из их среды.