Покровская церковь в селе Перхушково была построена в 1763 году на средства дворян Яковлевых, владельцев расположенной здесь усадьбы. В советские годы церковь не закрывалась. Перхушковский помещик Александр Алексеевич Яковлев в 1803 году на протяжении 11 месяцев был обер-прокурором Святейшего Синода, а его племянник писатель Александр Герцен планировал венчаться в Покровской церкви.
В селе Перхушково до революции располагалась ближайшая к Москве на Смоленской дороге почтовая станция. Здесь останавливались император Александр I, писатели Н. В. Гоголь, Л. Н. Толстой и многие другие. По воле Толстого герой романа "Война и мир" Пьер Безухов по пути в Бородино также "остановился" в Перхушково. Есть мнение, что в 1812 году в Перхушково ночевал сам Наполеон, но это всего лишь легенда. При этом Наполеон действительно упоминал Перхушково в письме своему кузену, советуя ему обойти село стороной из-за стоявших там русских батарей. Покровский храм изобразил Фабер дю Фор - французский художник, который сопровождал наполеоновскую армию в России.
Также Перхушково знаменито своей больницей, история которой связана с Покровским храмом. К слову, ближайшая к церкви платформа поэтому и называется "Здравницей". В 1891 году настоятель Покровской церкви Павел Троицкий был одним из главных инициаторов строительства здесь земской больницы. Священник нашел для этого жертвователей из числа местных помещиков. Правда, располагалась она тогда в обыкновенной избе. При больнице в дальнейшем по инициативе Павла Троицкого было создано Благотворительное общество, а также построена часовня. Нынешнее здание больницы построено в 2004 году, однако на территории сохранился и один небольшой старинный домик. В советские годы Перхушковская больница считалась крупным медицинским центром.
Упоминавшийся священник Павел Троицкий был зятем прежнего перхушковского священника Никиты Речменского. О. Павел Троицкий был настоятелем Покровской церкви около 40 лет, и начал свое служение в Перхушково в 1884 году. В этот период был проведен капитальный ремонт церкви, обновлены иконостасы, устроен новый придел св. Александра Невского (в память императора Александра II и освобождения крестьян). О. Павел Троицкий провел ремонт земской школы, создал местное общество хоругвеносцев.
В 1930-е годы настоятелем Покровского храма стал Александр Виноградов, вторым священником служил о. Василий Хромов. В 1937 году оба были арестованы, и службы прекратились. Однако в 1943 году по просьбе жителей села богослужения были возобновлены.
При Хрущеве церковь пытались закрыть второй раз. В 1962 году звенигородская газета "Знамя Ильича" опубликовала статью с издевательским заголовком "Перхушковская церковь – гнездо интриганов и мракобесов". Это было началом целой кампании, целью которой было закрытие храма и передача здания Голицынской птицефабрике под клуб. К этой кампании привлекли и медработников упоминавшейся Перхушковской больницы, рабочих фабрики соседнего села Юдино.
Тогда же в Покровскую церковь прибыла медицинская комиссия для обследования храма из-за распространения вирусов. Комиссию возглавляла женщина, и когда она потребовала допуска в алтарь, прихожане загородили ей вход. На священника за это было открыто уголовное дело, его арестовали. Однако прихожане стали жаловаться на действия властей, и вскоре священника отпустили. Все эти провокационные действия и предлоги оказались тщетными, храм так и не закрыли.
Местный дьякон отправлял письма в разные советские учреждения, в которых разъяснял, что Перхушковский храм имеет культурное и историческое значение, так как в нем собирался венчаться со своей невестой Александр Герцен. На самом деле Герцен в Перхушкове бывал редко, а его свадьба в итоге состоялась во Владимире. Но в советские годы имя "первого революционера" имело настолько большой вес, что, возможно, Покровскую церковь сохранили в том числе и по этой причине.
Основал усадьбу в Перхушково двоюродный дед Герцена Михаил Александрович Яковлев. При нем же в 1763 году была возведена нынешняя каменная церковь. В дальнейшем усадьбой Перхушково владел родной дядя писателя Александр Алексеевич Яковлев. Именно на его дочери Наталье – то есть на собственной двоюродной сестре – Герцен и хотел обвенчаться в Покровской церкви.
Александр Алексеевич Яковлев в годы царствования Александра I несколько месяцев был обер-прокурором Святейшего Синода. Обер-прокурор не был лицом духовным, более того, им мог стать человек далекий от Церкви. Однако архиереи нередко ставили под контроль гражданского чиновника: все зависело от личных качеств обер-прокурора и членов Синода. Например, при императоре Павле I митрополит Санкт-Петербургский Амвросий Подобедов добился назначения удобного для себя обер-прокурора.
Александр Яковлев стал для Синода фигурой, напротив, очень неудобной. С первых же дней новый обер-прокурор вступил в конфликт с архиереями, но в итоге... проиграл. Яковлев был назначен на должность в начале 1803 года, а уже в октябре царь сместил его. О своем печальном опыте бывший обер-прокурор Яковлев оставил воспоминания, которые назвал "исповедью честного человека, пострадавшего за верность к своему государю". Вступив в должность, он обнаружил в церковных делах много неисправностей, решил навести порядок в финансах Синодальной типографии. Митрополит Амвросий Подобедов в устной беседе советовал ему быть скромнее и не лезть в церковные дела:
Будьте с нами как предместник ваш… не подражайте Чебышеву и князю Хованскому; первого мы проклинаем, а второго угнали мы в Симбирск и едва не в Сибирь. За указ о типографии мы теперь вас простим, если вы вперед обещаете ни о чем государю не докладывать, не спросясь нас.
Яковлев был возмущен таким советом. Он попытался продолжать свою линию, но поплатился тем, что был отправлен в отставку. О себе же Яковлев писал как о жертве интриг:
Я с моей правотой оставался один, беспомощен… Я – христианин и на Бога твердо надеюсь; но претерпение мое выше сил человеческих!
Впрочем племянник уволенного обер-прокурора Александр Герцен в своем знаменитом сочинении "Былое и думы" говорил о дяде как о человеке неглубоком, который всю жизнь провел в "праздной пустоте".
Сын А. А. Яковлева стал последним владельцем Перхушково из этой дворянской семьи. Он был нелюдимым ученым-любителем, жил уединенно и ставил в усадьбе химические опыты. Наконец, он уехал в Петербург, освободил своих крестьян, а запущенную усадьбу оставил управляющему Филиппу Кузьмичу Жилкину. Тот стал впоследствии звенигородским купцом, держал трактир в Голицыно. На средства Жилкина в 1873 году была построена Перхушковская земская школа.
Последней владелицей Перхушково до революции 1917 года была актриса Малого театра Елена Александровна Благово-Доброхотова. Крестьяне называли ее доброй барыней, а за усадебным домом на долгие годы в народе закрепилось название "доброхотовского".
В 2022 году усадебный дом, расположенный совсем рядом с Покровской церковью, был отреставрирован. При работах по укреплению фундамента археологи случайно нашли старинное кладбище, в том числе около 80 надгробных плит XVI века. А в дальней части усадьбы был найден фундамент старинного деревянного храма, предшественника нынешней каменной Покровской церкви.
PS. В 2024 году вышла книга "Летопись Покровского храма и села Перхушково" (в двух томах). Она была создана командой энтузиастов под руководством Александры Авраменко