Искусные в обходе защитных механизмов, вирусы успешно уклоняются от обнаружения как иммунной системой организма, так и специализированными алгоритмами анализа. Недавнее научное изыскание позволило обнаружить порядка четырех тысяч прежде не выявленных элементов, укрытых в вирусном генетическом материале.Вирусы демонстрируют поразительное мастерство в сокрытии информации, их геном содержит множество потенциальных протеинов, долгое время остававшихся вне поля зрения ученых. Благодаря использованию метода высокопроизводительного рибосомного профилирования (MPRP), научная группа под руководством Ширы Вайнгартен-Габбай смогла идентифицировать более 4000 ранее неизвестных участков в генетических кодах 679 вирусов, связанных с человеческим организмом. Эти области, известные как открытые рамки считывания (ОРС), способны кодировать белки, играющие ключевую роль в вирусном противостоянии иммунитету, и представляющие собой многообещающие цели для создания новых вакцин.Рибосомное профилирование представляет собой технологию, позволяющую получить своего рода "мгновенный снимок" процесса считывания РНК рибосомой. Путем анализа этих "снимков" становится возможным определение активных генов в конкретный момент времени. В MPRP данный процесс осуществляется параллельно для тысяч фрагментов, что и нашло отражение в названии метода.Результаты данного исследования были представлены в журнале Science.В прошлом, для поиска ОРС применялись компьютерные алгоритмы, однако они нередко выдавали неточные результаты. Культивирование опасных вирусов в лабораторных условиях также сопряжено с определенными рисками. Ученые предпочли альтернативный подход: они фрагментировали вирусные геномы, внедрили полученные фрагменты в клетки и отслеживали, какие участки РНК связываются с рибосомами "фабриками" по производству белков. Это позволило обнаружить сотни ранее неидентифицированных пептидов. Некоторые из них участвуют в регулировании презентации антигенов (то есть, в процессе "демонстрации" иммунным клеткам, кого следует атаковать), оказывают влияние на Т-клеточный ответ или даже регулируют сборку вирусных протеинов.Значимость исследования:Вакцины: Новые ОРС являются потенциальными мишенями для разработки вакцин, особенно в отношении сложных вирусов, таких как ВИЧ или герпес.Диагностика: Выявление скрытых белков в крови может повысить точность диагностики инфекционных заболеваний.Иммунотерапия: Понимание механизмов, посредством которых вирусные пептиды управляют Т-клетками, может позволить усилить противоопухолевый иммунный ответ.Важно отметить, что метод MPRP позволяет обнаруживать ОРС, но не предоставляет окончательных доказательств их функциональной активности в условиях реальной инфекции. Вирусы могут активировать эти гены только в определенных условиях, например, при хронической инфекции. Следовательно, без проведения дополнительных исследований, часть обнаруженных ОРС останется лишь гипотетической, сообщает innovanews.
Обратите внимание: Почему бедные остаются бедными: 5 установок, которые мешают разбогатеть