Город Ярославль был основан в начале 11-го века Великим князем Ярославом Мудрым и в 17-м веке стал вторым городом Русского государства.
Спасо -Преображенский монастырь был основан в 1216 году, за стенами города, став по сути одним из угловых городских оборонительных сооружений. С начала основания в монастыре работало первое в Северо Восточной Руси духовное училище и была основана библиотека, при которой была организована переписка книг. В 1224 году был построен величественный Спасо- Преображенский собор и монастырь стал духовным и просветительским центром Ярославского княжества. Деревянный монастырь часто страдал от пожаров и после очередного большого пожара в 1501 году, по решению отца Ивана Грозного великого князя Василия 3-го, было решено строить каменный монастырь. В 1516 году осветили первое каменное здание Ярославля - новый Спасо-Преображенский собор, воссозданный по образу соборов Московского кремля.
Вслед за собором была построена Звонница и Святые ворота с церковью Введения во храм Святой богородицы и возведены каменные стены, которые сделали монастырь главной цитаделью Ярославской крепости еще при Иване Грозном. В смутные времена 1609 года Спасо-Преображенский монастырь вместе с Земляным городом, где располагался деревянный Кремль, выдержали осаду польских войск пана Будзило и воеводы Наумова. В 1612 году именно от стен монастыря двинулось ополчение Минина и Пожарского на освобождение Москвы. Весной 1613 года отсюда отправил свою первую грамоту о согласии на престол будующий царь Михаил Романов.
Благодаря тому, что Спасо-Преображенский монастырь не когда не был захвачен и разорен врагами он сохранил в основном свою средневековую архитектуру. В 1787 в связи с переездом в Ярославль Ростовского митрополита, монастырь был преобразован в Ярославский архирейский дом.
Даже при Советской власти, благодаря вкладу монастыря в историю российского государства, храмы монастыря разрушать не стали. Спасо-Преображенский собор до 1918 года был действующий, сразу после его закрытия начались работы по сохранению и восстановлению россписей сохранившихся со времен Ивана Грозного.
Фрески написанные в 1563-1564 годах, по указанию Ивана Грозного, являются древнейшими памятниками русской настенной россписи и в таком хорошем качестве сохранились еще только в Успенском соборе Свияжского Успенского монастыря.
Для сохранения фресок начале 1920-х годов Ярославская реставрационная комиссия под руководством Иллариона Тихомирова отремонтировала разрушенные части здания, разобрала апсиду XVIII века и переделала окна в формы XVI века.
Потом здание восстанавливали в 1950-х годах. С 1959 года бывшая монастырская территория принадлежит Ярославскому государственному историко-архитектурному и художественному музею-заповеднику и в настоящее время именно он следит за сохранностью бесценных фресок. По этому здание Спасо-Преображенского собора, которое работает как музей, открыто только в теплое время года.
На территории монастыря есть еще несколько музеев в которых собраны золотые предметы церковной посуды, утвари и предметов для совершения церковных обрядов, а так же древние иконы и другие предметы старины. Но главным является музей, который содержит экспозицию рассказывающую о "Слове о полку Игореве". Рукопись, была найдена в ризнице Спасо-Преображенского собора и выкуплена в 1792 году у его бывшего архимандрита Иоиля, представителем собирателя древностей и историка А. И. Мусина-Пушкина.
После перевода на современный язык в 1800 году рукопись была опубликована и стала сенсацией для всего мирового научного сообщества. Документ написанный в 1185 году позволил в новом свете увидеть древнюю историю государства российского.
В "Слове" подробно рассказывается о походе князя Игоря Святославовича, совершенном против половцев в 1185 году. Князь собрал большое войско со всех северных земель и дал бой на реке Кияле войску половецкого хана Кончака. В результате двух боев русское войско было разбито, а сам князь взят в плен. Произведение написано в виде примитивной поэмы и сочетает элементы славы и плача , включает фольклорные образы, языческие и христианские элементы. Сюжетное повествование прерывается монологами героев и авторскими лирическими отступления автора с обзором истории Руси. Автор «Слова» прославляет Игоря Святославовича как храброго полководца, борющегося с врагами Руси и христианства, но в то же время осуждает его за самовольный поход, приведший к поражению.
Древняя рукопись повлияла на творчество Гоголя, Блока, Есенина и многих других поэтов и писателей, легла в основу ряда картин Васнецова и Перова и музыкальных произведений ( опера Бородина "Князь Игорь" ).
Величие произведения и его значение в русской культуре и выражает экспозиция расположенная в бывшей трапезной и патриарших покоях Спасо-Преображенского монастыря.
Здесь представлены доспехи и оружие воинов времен князя Игоря, подлинные артефакты, найденные на местах боев, иконы и картины прославляющие князя Игоря и его воинство.
Но главное сокровище музея книги, когда то вручную написанные монахами древних русских монастырей, которые в свое время обучили писать и читать русский народ.