В ночь на 13 июня 2025 года (примерно в 3 часа по московскому времени), Израиль атаковал Иран. Атака была комбинированной. Были задействованы ракеты, авиация, беспилотники. Удары по важным и стратегическим объектам Ирана наносились в том числе с территории самого Ирана, куда заранее были внедрены агенты и приготовлены беспилотники (некий аналог украинской операции "Паутина" против российской стратегической авиации).
Первые удары Израиля были нацелены на то, чтобы парализовать управление, путём устранение ключевых фигур армейского руководства Ирана. Некоторые удары наносились точечно. Также первые удары были нацелены на иранских физиков-ядерщиков. По поступившей информации были убиты 6 иранских физиков-ядерщиков. Помимо этого удары наносились по установкам ПВО и ракетным установкам.
Одной из основных целей Израиля стало подавление ПВО Ирана. С этой целью Израиль нанёс удары по ключевым элементам иранской ПВО, включая радар раннего предупреждения в Западной зоне ПВО Хатам-оль-Анбия в провинции Хамадан. Другие удары были нанесены по базе ПВО защищающей ядерный объект в Фордо. Нарушение работы систем иранской ПВО позволит израильским самолётам 4-го поколения, лишённым малозаметности, активно действовать над территорией Ирана. Также израильские ракеты и беспилотники нанесли удары по многочисленным иранским ракетным шахтам и пусковым установкам баллистических ракет. В результате этих ударов были уничтожены часть иранских ракет и ракетных установок. Также Израиль наносил удары по военному клиндованию Ирана, чтобы обезглавить иранское армейское руководство. Однако, Верховный лидер Ирана Али Хаменеи быстро назначил новых людей на большинство руководящих армейских постов.
С целью подорвать возможности Ирана по обогащению урана, Израиль наносил удары и по иранской ядерной инфраструктуре. Так были нанесены удары по нескольким объектам на обогатительном комплексе в Натанзе. По данным спутниковых снимков, израильскими аваиударами уничтожен завод по обогащению ядерного топлива в Натанзе. На заводе размещалось более 1700 современных цнтрифуг, включая центрифуги IR-4 и IR-6, для производства урана обогащённого на 60%. Спутниковые снимки также подтвердили, что в результате удара были повреждены электрические подстанции и вспомогательные здания, имеющие решающее значение для электроснабжения всего региона. Генеральный директор Международного агентства по атомной энергии (МАГАТЭ) Рафаэль Гросси, что по иранскому ядерному объекту в Натанзе был нанесён удар. Радиационный фон при этом остался в норме. Израильская сторона заявила, что удар по объекту в Натанзе повредил его, но не уничтожил.
Израиль также нанёс удар по ядерным объектам в Исфаханском центре ядерных технологий (ENTC) в провинции Исфахан, включая установку по производству металлического урана и инфраструктуру для переработки обогащённого урана в ядерное топливо. В Центре находится несколько других ядерных объектов, включая установку по переработке урана, завод по производству топлива и лабораторию по изготовлению топлива, а также реакторы.
В Фордо в результате израильского удара погиб 1 полковник "Атеш" и 1 солдат на объекте противовоздушной обороны "Хазрат-и-Масуме" в провинции Кум, который защищает ядерный объект в Фордо.
Израильская армия наносила удары по иранским военным объектам, включая крупную ракетную базу в провинции Керманшах. Спутниковые снимки показали, что израильскими ударами уничтожен объект, который мог использоваться для хранения баллистических ракет. Также ЦАХАЛ нанёс удары по 2-й тактической авиабазе ВВС Артеш в Тебризе и другим военным объектам в провинции Восточный Азербайджан.
Помимо этого израильские удары были нанесены по нескольким районам в провинции Тегеран. Взрывы были слышны в кварталах Робат-Карим, Бахарестан, Малард и Шахри-Рей.
Иранские системы ПВО активизировались над Андимешком и Дезфулом (провинция Хузестан), Исфаханом, Пакдаштом (провинция Тегеран) и Кумом.
Иранские официальные лица подтвердили, что удары были нанесены в Бостан-Абаде и Мараге (провинция Восточный Азербайджан), а также в провинции Зенджан. Иранские официальные лица подтвердили ущерб авиабазе Тебриз и аэропорту Мадани.
Сообщалось о взрывах в Буин-Захре (провинция Газвин) и Мохаммад-Шахре (провинция Альборз).
ЦАХАЛ атаковал иранских учёных-ядерщиков. По последним данным было убито 6 иранских учёных из Университета Шахида Бехешти. Университет Шахида Бехешти, расположенный в Тегеране играет важную роль в иранской ядерной программе. США и Европейский Союз ввели санкции против этого университета за его связи с иранской ядерной программой.
В результате израильских ударов убит командующий силами КСИР в Кудсе бригадный генерал Эсмаил Гани. Гани занял этот пост после того, как Соединённые Штаты убили его предшественника Кассема Сулеймани в Багдаде в январе 2020 года. Всего в результате израильских атак в Иране 78 человек погибли, 230 получили ранения.
В первые часы израильской атаки Иран ответил запуском 100 беспилотников "Шахидов". Однако, это не был полноценный ответ, а скорее "лишь бы чем-то ответить". В итоге все беспилотники были сбиты на подлёте к Израилю. Полноценный ответ произошёл только на исходе дня. Иран в три волны нанёс удар по Израилю баллистическими ракетами. Запущено было по разным данным от 100 до 200 ракет. Часть из них были сбиты, но несколько ракет всё же пробили израильскую ПВО. Сообщается, что как минимум 7 израильских ракет упали в Тель-Авиве. Также иранские ракеты поражали цели в северной части Израиля. Иранская операция получили название "Истинное обещание III". В результате иранского ответа со стороны Израиля 2 человек погибли, 70 человек получили ранения.
Президент Ирана Масуд Пезешкян провёл телефонный разговор с президентом России Владимиром Путиным, который стал первым разговором Пезешкяна с иностранным лидером с момента начала воздушных ударов по Ирану со стороны Израиля. Пезешкян и Путин обсудили израильские удары.
Из всех иранских прокси делом поддержали Иран только йеменские хуситы. Они выпустили ракету, которая упала в районе Хеврона в Израиле. Остальные иранские прокси выступили с обсуждениями израильской атаки.
Президент США Дональд Трамп заявил, что последуют "ещё более жёсткие" атаки на Иран, если Иран не согласится на ядерную сделку с Соединёнными Штатами. Иран, в свою очередь, после израильских ударов объявил о выходе из американо-иранских переговоров по ядерной программе. Трамп написал в социальных сетях, что израильские удары были нанесены через день после истечения срока его 60-дневного ультиматума Ирану. Трамп сказал, что у Ирана теперь есть "второй шанс" заключить сделку, и что он надеется, что Иран вернётся за "стол переговоров". Американо-иранские переговоры теперь оказались приостановлены на неопределённый срок.