Профессор Ахметзянов имеет более 10 патентов и авторских свидетельств, опубликовал свыше 400 научных работ. Более 30 учебно-методических работ под его авторством широко используются в педагогической практике.
Ф.Ш. Ахметзянов разработал и внедрил в клиническую практику более 15 видов операций при злокачественных новообразованиях основных локализаций, которые позволили резко повысить отдаленные результаты лечения и снизить частоту послеоперационных осложнений и летальность.
По его инициативе в Казани была создана служба экстренной и неотложной помощи онкологическим больным, которая не имеет аналогов в мире.
Общий стаж врачебной, научной и педагогической деятельности Фоата Шайхутдиновича составляет 56 лет. Он возглавляет хирургическую клинику лечебно-диагностического корпуса №2 РКОД, осуществляет общее методическое руководство, консультирует больных, находящихся на стационарном лечении, а также в лечебно-профилактических учреждениях Казани, других регионов России и ближнего зарубежья.
