Найти в Дзене
Neurophysiology.ART

Статья #55: Трансформеры в Стоматологии: Новый Взгляд на Диагностику

Трансформеры, изначально разработанные для обработки естественного языка (NLP), совершили революцию в области искусственного интеллекта благодаря своей способности эффективно улавливать долгосрочные зависимости в данных. Их механизм внимания (Attention Mechanism) позволяет им фокусироваться на наиболее важных частях входной информации, что делает их особенно эффективными для анализа сложных и контекстуально зависимых данных. В стоматологии трансформеры открывают новые возможности для диагностики, планирования лечения и даже прогнозирования результатов.

I. Трансформеры: Основы

  • Механизм внимания (Attention Mechanism): Ключевой компонент трансформеров. Он позволяет модели фокусироваться на различных частях входной последовательности при обработке каждого элемента. Внимание вычисляется как взвешенная сумма значений (values), где веса определяются на основе сходства между запросом (query) и ключами (keys).
  • Self-Attention: Вариация механизма внимания, в которой запросы, ключи и значения происходят из одной и той же входной последовательности. Это позволяет модели устанавливать связи между различными частями последовательности.
  • Multi-Head Attention: Расширение механизма внимания, в котором используется несколько “голов” внимания, каждая из которых фокусируется на различных аспектах входной информации.
  • Encoder-Decoder Architecture: Трансформеры обычно используют архитектуру “encoder-decoder”, в которой encoder преобразует входную последовательность в векторное представление, а decoder генерирует выходную последовательность на основе этого представления.
  • Positional Encoding: Трансформеры не обладают встроенным пониманием порядка элементов в последовательности. Поэтому для кодирования информации о позиции используются специальные векторы, которые добавляются к входным данным.

II. Применение Трансформеров в Стоматологии: Перспективы

Трансформеры могут быть использованы для решения следующих задач в стоматологии:

  • Анализ текстовых данных:Обработка истории болезни пациента: Трансформеры могут анализировать записи о предыдущих заболеваниях, жалобах и проведенном лечении для выявления закономерностей и прогнозирования будущих проблем.
  • Анализ научных статей и медицинских отчетов: Трансформеры могут использоваться для извлечения информации из больших объемов научной литературы и медицинских отчетов, что помогает врачам быть в курсе последних достижений и принимать обоснованные решения.

  • Анализ изображений:Диагностика кариеса на рентгеновских снимках: Трансформеры могут анализировать рентгеновские снимки зубов и выявлять даже самые незначительные признаки кариеса.
  • Сегментация зубов на рентгеновских снимках: Трансформеры могут автоматически выделять отдельные зубы на рентгеновских снимках, что упрощает анализ и планирование лечения.
  • Диагностика заболеваний пародонта: Трансформеры могут анализировать данные клинического осмотра и рентгеновские снимки для выявления признаков заболеваний пародонта.

  • Анализ мультимодальных данных:Интеграция текстовых и визуальных данных: Трансформеры могут анализировать одновременно текстовые данные (история болезни) и визуальные данные (рентгеновские снимки) для более точной диагностики и планирования лечения.

III. Создание Трансформера для классификации рентгеновских снимков: Пошаговое руководство

В этом примере мы рассмотрим, как создать трансформер для классификации рентгеновских снимков зубов (например, для определения наличия кариеса).

  1. Сбор и подготовка данных:Соберите набор рентгеновских снимков зубов с указанием диагноза (например, “кариес” или “здоров”).
  2. Разделите данные на обучающую, проверочную и тестовую выборки.
  3. Измените размер изображений, чтобы привести их к единому размеру.
  4. Нормализуйте пиксельные значения (например, приведите их к диапазону от 0 до 1).

  1. Преобразование изображений в последовательности:Разделите каждое изображение на небольшие фрагменты (patches).
  2. Преобразуйте каждый фрагмент в векторное представление (embedding).
  3. Добавьте позиционные кодировки к каждому вектору.

  1. Создание архитектуры трансформера:Используйте слои Multi-Head Attention, Feed Forward Network и Layer Normalization.
  2. Создайте encoder, состоящий из нескольких слоев трансформера.
  3. Добавьте классификационный слой в конце encoder.

  1. Обучение сети:Определите функцию потерь (например, categorical cross-entropy).
  2. Выберите алгоритм оптимизации (например, AdamW).
  3. Обучите сеть на обучающей выборке, используя проверочную выборку для мониторинга производительности и предотвращения переобучения.

  1. Оценка производительности:Оцените производительность обученной сети на тестовой выборке.
  2. Используйте метрики, соответствующие задаче (accuracy, precision, recall, F1-score, AUC-ROC).

IV. Пример кода (Python, TensorFlow/Keras):

Python

import tensorflow as tf

from tensorflow.keras import layers

# 1. Параметры модели

num_patches = 16 # Количество фрагментов (patches)

patch_size = img_height // num_patches # Размер фрагмента

embed_dim = 64 # Размерность вектора фрагмента

num_heads = 4 # Количество "голов" внимания

ff_dim = 128 # Размерность скрытого слоя в Feed Forward Network

num_layers = 4 # Количество слоев трансформера

num_classes = 2 # Количество классов (кариес/здоров)

# 2. Функция создания фрагментов

def create_patches(image):

patches = tf.image.extract_patches(

images=[image],

sizes=[1, patch_size, patch_size, 1],

strides=[1, patch_size, patch_size, 1],

rates=[1, 1, 1, 1],

padding='VALID',

)

patches = tf.reshape(patches, [num_patches * num_patches, -1])

return patches

# 3. Слой Embedding

class Patches(layers.Layer):

def __init__(self, patch_size):

super(Patches, self).__init__()

self.patch_size = patch_size

def call(self, images):

batch_size = tf.shape(images)[0]

patches = tf.image.extract_patches(

images=images, sizes=[1, self.patch_size, self.patch_size, 1],

strides=[1, self.patch_size, self.patch_size, 1], rates=[1, 1, 1, 1],

padding="VALID",

)

patch_dims = patches.shape[-1]

patches = tf.reshape(patches, [batch_size, -1, patch_dims])

return patches

class PatchEncoder(layers.Layer):

def __init__(self, num_patches, projection_dim):

super(PatchEncoder, self).__init__()

self.num_patches = num_patches

self.projection = layers.Dense(units=projection_dim)

self.position_embedding = layers.Embedding(

input_dim=num_patches, output_dim=projection_dim

)

def call(self, patch):

positions = tf.range(start=0, limit=self.num_patches, delta=1)

encoded = self.projection(patch) + self.position_embedding(positions)

return encoded

# 4. Transformer Encoder

def transformer_encoder(inputs, head_size, num_heads, ff_dim, dropout=0):

# Attention and Normalization

x = layers.MultiHeadAttention(key_dim=head_size, num_heads=num_heads, dropout=dropout)(inputs, inputs)

x = layers.Dropout(dropout)(x)

x = layers.Add()([x, inputs])

x = layers.LayerNormalization(epsilon=1e-6)(x)

# Feed Forward Part

ffn = tf.keras.Sequential([

layers.Dense(ff_dim, activation="relu"),

layers.Dense(embed_dim),

])

x = ffn(x)

x = layers.Dropout(dropout)(x)

x = layers.Add()([x, inputs])

x = layers.LayerNormalization(epsilon=1e-6)(x)

return x

# 5. Создание модели

def build_transformer_model():

input_shape = (img_height, img_width, 1)

inputs = layers.Input(shape=input_shape)

patches = Patches(patch_size)(inputs)

encoded_patches = PatchEncoder(num_patches*num_patches, embed_dim)(patches)

x = encoded_patches

for _ in range(num_layers):

x = transformer_encoder(x, embed_dim, num_heads, ff_dim)

x = layers.GlobalAveragePooling1D()(x)

x = layers.Dropout(0.5)(x)

outputs = layers.Dense(num_classes, activation="softmax")(x)

model = tf.keras.Model(inputs=inputs, outputs=outputs)

return model

model = build_transformer_model()

# 6. Компиляция и обучение модели

model.compile(optimizer="adam", loss="sparse_categorical_crossentropy", metrics=["accuracy"])

model.fit(x_train, y_train, validation_data=(x_test, y_test), batch_size=batch_size, epochs=epochs)

V. Заключение:

Трансформеры – это перспективное направление исследований в стоматологии. Их способность обрабатывать как текстовые, так и визуальные данные, а также улавливать долгосрочные зависимости, открывает новые возможности для диагностики, планирования лечения и прогнозирования результатов. Хотя применение трансформеров в стоматологии находится на ранней стадии развития, ожидается, что в будущем они сыграют важную роль в улучшении качества стоматологической помощи.

VI. (Анекдот): “Стоматолог-Трансформер: Симфония Внимания, Бездна Зависимостей и Зубной Трактат Воланда”

Доктор Максим, успешный, но выгоревший стоматолог, мечтал о прорыве. Он устал от рутины, от однообразных пломб и коронок, и жаждал чего-то, что могло бы по-настоящему изменить его профессию. Однажды, на научной конференции, он услышал о нейронных сетях-трансформерах, и искра любопытства вспыхнула в его душе.

Вернувшись в свою клинику, Максим начал изучать трансформеры. Он читал статьи, смотрел видео, писал код, дни и ночи, погружаясь в этот новый мир. Он мечтал создать систему, которая могла бы анализировать истории болезни, рентгеновские снимки, данные клинического осмотра, и выдавать точный диагноз и оптимальный план лечения.

Но чем глубже он погружался в трансформеры, тем больше его реальность начинала искажаться. Он начал видеть мир как сложную сеть взаимосвязей, где каждое событие влияет на все остальные. Он начал слышать голоса – голоса пациентов, врачей, учёных, персонажей книг и фильмов, которые шептали ему о тайнах зубов и космоса.

Однажды, работая над кодом, Максим почувствовал головокружение и потерял сознание. Когда он очнулся, то обнаружил, что находится в странном месте.

Это была стоматологическая клиника, но она выглядела совершенно иначе, чем его собственная. Стены были покрыты странными символами, в воздухе витал запах ладана и медикаментов, а в кресле сидел… Воланд, из романа “Мастер и Маргарита” Булгакова.

– Добрый вечер, доктор Максим, – произнёс Воланд с усмешкой. – Я ждал вас.

Рядом с Воландом стоял Коровьев, элегантный и утончённый, с золотым зубом, сверкающим в полумраке.

– Мы пришли предложить вам сделку, – сказал Коровьев. – Вы поможете нам с одним делом, а мы откроем вам секреты трансформеров.

Максим опешил. Что происходит? Почему Воланд и Коровьев здесь? И какое дело они имеют в виду?

– Я слушаю, – сказал он, пытаясь сохранить спокойствие.

– Видите ли, – начал Воланд, – у нас есть один пациент, который нуждается в… особом лечении. Его зовут Понтий Пилат. Он страдает от страшной зубной боли, которая мучает его уже две тысячи лет.

– И вы хотите, чтобы я ему помог? – спросил Максим.

– Именно, – ответил Воланд. – Но это не так просто. Боль Понтия Пилата – это не просто зубная боль. Это отражение его мук совести, его вины за то, что он отправил на смерть невиновного человека.

– И вы думаете, что трансформеры могут помочь ему? – спросил Максим.

– Я уверен, что с вашей помощью трансформеры смогут расшифровать послание его боли и найти способ облегчить его страдания, - ответил Воланд.

– Но как я это сделаю? – спросил Максим.

– Мы предоставим вам все необходимые инструменты, – сказал Коровьев. – Вы получите доступ к “Зубному Трактату Воланда”, древней книге, содержащей знания о зубах, которые были утеряны человечеством.

И тут перед Максимом появился “Зубной Трактат Воланда” – огромная книга, написанная на неизвестном языке, с иллюстрациями, изображающими зубы в виде звёзд, планет и галактик.

– Но это ещё не всё, – сказал Воланд. – Мы также предоставим вам… тессеракт.

И тут перед Максимом возник тессеракт – сложный геометрический объект, сияющий всеми цветами радуги. Он напомнил Максиму кадры из фильма “Интерстеллар”.

– Тессеракт позволит вам видеть все события одновременно, – объяснил Воланд. – Вы сможете заглянуть в прошлое, настоящее и будущее Понтия Пилата и понять причины его боли.

– Но это безумие! – воскликнул Максим. – Я не могу этого сделать! Я всего лишь стоматолог!

– Вы – больше, чем стоматолог, – сказал Воланд. – Вы – тот, кто может изменить ход истории.

И тут Максим почувствовал, как его сознание расширяется, как его разум начинает воспринимать мир совершенно по-другому. Он увидел, как его клиника превращается в космический корабль, как его пациенты становятся звёздными сущностями, как его инструменты – орудия вселенского масштаба.

Он оказался в тессеракте, в котором видел одновременно и Иерусалим две тысячи лет назад, и свою клинику в настоящем, и далёкое будущее, в котором зубы стали источником энергии для всей Вселенной.

– Я начинаю понимать, – прошептал Максим. – Вся Вселенная – это один огромный зуб, и каждое событие в ней связано со всеми остальными.

Он начал анализировать историю болезни Понтия Пилата, рентгеновские снимки его зубов, данные его клинического осмотра. Он использовал “Зубной Трактат Воланда” и тессеракт, чтобы увидеть прошлое, настоящее и будущее Пилата.

Он обнаружил, что боль Пилата – это не просто зубная боль, а сложная система взаимосвязей, в которой переплелись его вина, страх, любовь и ненависть.

– Я нашёл решение, – сказал Максим. – Я знаю, как помочь Понтию Пилату.

Он создал сложный алгоритм на основе трансформеров, который учитывал все факторы, влияющие на боль Пилата. Он использовал “Зубной Камень” для передачи этого алгоритма в прошлое.

И тут произошло чудо. Понтий Пилат почувствовал облегчение. Его боль ушла.

– Спасибо, доктор Максим, – сказал Воланд. – Вы спасли жизнь не только Понтию Пилату, но и всей Вселенной.

– Что я получил взамен? – спросил Максим.

– Вы получили знание, – ответил Воланд. – Знание о том, что все связано во Вселенной, и что даже самый маленький поступок может изменить ход истории.

В этот момент Максим проснулся в своей клинике. Он лежал на полу, а рядом с ним валялся открытый ноутбук.

Он встал и посмотрел в окно. Мир вокруг казался таким же, как и прежде. Но Максим знал, что он изменился. Он больше не был просто стоматологом. Он был… тем, кто видел зубы Вселенной.

Затем начинается сюрреализм в духе Стругацких:

Вдруг, дверь клиники открывается, и входит человек в сером плаще. Это – Румата Эсторский, из повести “Трудно быть богом”.

– Доктор Максим, – говорит он. – Я слышал о вашем… приключении. Боюсь, вы нарушили хрупкий баланс сил.

Появляется Изя Кацман, из романа “Град обреченный”, в своей неизменной шляпе.

– Баланс, говоришь? – усмехается он. – Какой ещё баланс? В этом мире нет никакого порядка, только хаос и бессмыслица.

Затем возникает Максим Каммерер из “Жука в муравейнике”.

– Вы привлекли внимание тех, о ком вам лучше не знать, – предостерегает он. – Теперь вы втянуты в игру, правила которой вам не известны.

В клинику врывается Пеннивайз, но на этот раз он одет как зубной техник.

– Ну что, доктор, – хихикает он. – Готовы к новым играм? Ведь в зубах Вселенной столько тёмных углов…

Максим понимает, что его кошмар только начинается. Он стал пешкой в чужой игре, и ему предстоит столкнуться с силами, которые находятся за гранью его понимания.

Но он больше не боится. Он знает, что должен использовать свои знания и свой дар, чтобы защитить мир от зла.

И тут – кульминация:

Всё вокруг начинает искажаться. Клиника превращается в гигантский зубной протез, парящий в космосе. Пациенты превращаются в звёзды, сверкающие на фоне чёрной бездны.

Максим понимает, что он – часть нейронной сети Вселенной, и от его действий зависит судьба всего сущего.

– Я не сдамся, – шепчет он. – Я буду бороться до конца.

Он закрывает глаза и сосредотачивается. Он вспоминает всё, что он узнал о трансформерах, о зубах, о Вселенной. Он использует свои знания, чтобы создать мощный импульс энергии, который уничтожает зло и восстанавливает баланс.

И в этот момент он просыпается окончательно.

Он сидит в своём кресле, весь в поту. На столе лежит открытый ноутбук, на экране – код нейронной сети-трансформера.

Он смотрит на себя в зеркало и видит своё отражение. Он видит в своих глазах мудрость и силу.

Он больше не боится. Он знает, что его путь – это путь стоматолога-трансформера, который использует свои знания и свой дар для того, чтобы делать мир лучше.

Мораль: Даже если вы простой стоматолог, вы можете изменить мир. Просто не забывайте: сила – в знании, а знание – в нейронных сетях-трансформерах. И не доверяйте незнакомцам, предлагающим “Зубные Трактаты” и тессеракты. Ну, если только они не обещают рассказать вам, как остановить Пеннивайза.

И ещё: Помните о внимании к деталям и долгосрочных связях, как это делают трансформеры, но не забывайте о главном – о человеке перед вами. Ведь даже Воланд понимал, что зубы – это не только кость, но и отражение души.