В 1943 г. он был назначен командиром 119-го разведывательного авиаполка (в январе 1944 г. преобразован в 13-й гвардейский дальнебомбардировочный). Полк под командованием Н. А. Мусатова участвовал во всех операциях на Черном море, особенно отличился в период освобождения Крыма. Применяя способ топ-мачтового бомбометания, летчики полка потопили 10 неприятельских транспортов общим водоизмещением 18 300 т, 6 сторожевых катеров, 3 десантные баржи. За боевые отличия 13-й гвардейский полк стал именоваться Констанцским Краснознаменным авиаполком. Командир полка гвардии подполковник Н. А. Мусатов произвел 247 боевых вылетов, в том числе 89 на дальнюю воздушную разведку кораблей противника в море и его ВМБ, 98 вылетов на бомбовые удары по военным и промышленным объектам врага, 60 вылетов на бомбовые удары по переднему краю вражеской обороны. В представлении на Н. А. Мусатова к званию Героя Советского Союза записано: «За эффективное боевое использование вверенного оружия и частей на всех этапах войны и проявленные при этом храбрость и геройство достоин... присвоения звания Героя Советского Союза».
/Герои Советского Союза Военно-Морского флота. Биографический справочник. – Москва: Воениздат, 1977, с.335/.
Указом Президиума Верховного Совета СССР от 15 мая 1946 года гвардии капитану Н.А. Мусатову присвоено звание Героя Советского Союза.
