Монастырь был основан в 1585 году при царе Фёдоре Иоанновиче старцем Онуфрием по жалованной грамоте царя, в которой повелевалось «воздвигнуть храм на Жабынском городище и монастырь строить».
В 1615 году Жабынская пустынь была разорена польским войском пана Лисовского – на ее месте остались развалины, братия была перебита. Своим возрождением пустынь обязана преподобному Макарию, который после ухода захватчиков вернулся на пепелище родной обители и принялся за ее восстановление.
Преподобный Макарий Жабынский, Белевский чудотворец, родился в 1539 году в царствование Иоанна Васильевича Грозного. О жизни его до монашества, а так же о том, где было начало его иноческих трудов и подвигов, письменных известий не сохранилось.
Он построил новую церковь в честь Введения во храм Пресвятой Богородицы и собрал братию, став их игуменом. Скончался он в возрасте 84 лет в 1623 году. После его смерти пустынь стала именоваться Макариевской.
В конце того же 17-го века, Жабынская пустынь опять запустела, жившие в обители монахи разбрелись по другим монастырям.
В 1710 году чудотворный образ Знамения Божией Матери был перенесён из Калужской губернии, села Озёрска в Макариевскую Жабынскую пустынь.
В 1889 году в Жабынской пустыни была торжественно совершена закладка каменного храма во имя преподобного Макария Жабынского на месте прежней Никольской церкви, где находились мощи святого.
В сентябре 1921 года Свято-Введенский Макарьевский Жабынский монастырь был упразднён, его храмы закрыты.
С 1927 по 1941 годы на территории бывшего Жабынского монастыря размещался штаб 250-го стрелкового полка. В декабре 1941 года Жабынь оказалась в зоне ведения активных боевых действий.
С 1947 по 1975 годы в здании Макарьевского храма располагалась сельская школа, а после 1975 года до 80-х годов на территории Жабыни размещался пионерский лагерь, в здании Знаменского храма находилась столовая для детей.
В мае 1991 года Священный Синод благословил открытие Свято-Введенской Макариевской пустыни.
На территории монастыря находится святой источник и при нём купальня.
Этот источник, согласно монастырскому преданию, появился 1615 году по молитве преподобного Макария Жабынского и Белёвского чудотворца.
В советское время часовня была разрушена, а колодец засыпан грунтом и заложен бетонными плитами. Но вода всё равно пробивалась из нескольких мест под плитами.
Современная купальня была построена в 2000 году, но не на месте прежней, а чуть в стороне от колодца.
В 2019 году в рамках подготовки к празднованию 500-летия Тульского кремля и Большой засечной черты проведена реставрация старинного Макариевского храма монастыря, благоустроена его территория и на шоссе Тула— Белёв у поворота на монастырь установлена часовня с иконой преподобного Макария Жабынского. Макариевский храм был освящен 4 февраля 2020 года епископом Белевским и Алексанским Серафимом (Кузьминовым)