Средние века — трудный период в судьбе амфитеатра. Как только его не использовали! Там находили себе место отшельники, ремесленники и лавочники. Пристроив к нему часовню, сделали кладбище на арене. Он служил крепостью для влиятельных родов, боровшихся за власть. Были планы сделать из него суконную фабрику, а, спустя годы, папа Климент IX превратил театр в завод по добыванию селитры. Только в 18 веке Бенедикт XIV вспомнил о том, что Колизей является местом пыток многих христианских мучеников и взял его под свою защиту. Однако достоверно известно, что на арене Колизея проходили казни, но христиан казнили, как правило, если они были военными, так как отказ военного приносить жертвы богам считался преступлением. Никаких надежных исторических свидетельств, подтверждающих, что именно здесь были массовые казни христиан, не имеется. Однако благодаря этому мнению удалось избежать полного уничтожения Колизея, который, в течение многих веков использовался римлянами как источник стройматериалов