Новая крупная работа Weill Cornell Medicine направлена на каталогизацию нормального человеческого вируса — огромной экосистемы вирусов, которая живет в нас и на нашей поверхности. Эта работа, проводимая в рамках межведомственного сотрудничества под названием Viromes Across Space and Time (VAST) при поддержке Национального института по проблемам старения, входящего в состав Национального института здравоохранения, позволит разработать новые методы, осветить важнейший аспект биологии человека, который ранее было невозможно изучить, и создать базовый набор данных, которые могли бы помочь в профилактике, диагностике и лечении заболеваний.
Большинство вирусов не вызывают у людей заболеваний. Действительно, вирусологи давно подозревали, что мир наводнен вирусами, которые не вызывают никаких заболеваний и которые невозможно обнаружить с помощью традиционных лабораторных тестов, но последние достижения в области секвенирования ДНК и РНК и биоинформатики наконец позволили им исследовать эту темную биологическую материю. Понятно, что большая часть этой работы была сосредоточена на том, как изменения в вироме могут способствовать развитию заболеваний. Новый проект затрагивает не менее важный вопрос: как выглядит здоровый виром?
“Мы хотим лучше понять вариативность, распространенность и разнообразие вирусов по всему миру, особенно у людей, которые просто живут обычной жизнью”, — сказал доктор Кристофер Мейсон, профессор геномики и вычислительной биомедицины в Weill Cornell Medicine и главный исследователь проекта. Д-р Александр Лукачи, ведущий автор исследования. постдокторант лаборатории доктора Мейсона добавил, что “большая часть того, что мы знаем о вирусах, связана с патогенами, но сейчас мы пытаемся понять те из них, которые просто существуют в нас, и на самом деле мы понятия не имеем, что они делают”.
VAST будет использовать обширную библиотеку образцов, которые уже собрала лаборатория доктора Мейсона, а также будет следить за другими участниками в течение пятилетнего периода реализации проекта и в последующий период. Участники — от детей и подростков до пожилых людей, из разных уголков мира, с самыми разными жизненными историями.
“У нас будут десятки тысяч образцов, лонгитюдные исследования, за которыми мы следим в течение многих лет, и дополнительные метаданные об их воздействии”, — сказал доктор Лукачи, возглавляющий биоинформационный анализ проекта.
Команды Weill Cornell Medicine и Stanford Medicine разделят работу поровну. В Weill Cornell Medicine группа доктора Мейсона сосредоточится на молекулярной биологии и вычислительной биологии, а доктор Инмакулада де Мело-Мартин, профессор медицинской этики в области медицины, проанализирует этику такого крупномасштабного сбора данных. Доктор Брейден Тирни, преподаватель вычислительной биомедицины в Weill Cornell Medicine, работает над компьютерными инструментами для проекта. В целом, VAST заложит основу для более комплексного подхода к вирусологии.
“Этот фундаментальный уровень информации поможет нам увидеть, как меняется нормальный уровень вирома в зависимости от различных заболеваний или предыстории человека, а также могут быть вирусы, которые обычно протекают бессимптомно и становятся условно-патогенными микроорганизмами”, — сказал доктор Мейсон, который также является профессором физиологии и биофизики в медицинском центре Weill Cornell Medicine.
Если Вам понравилась статья, просим поставить лайк и подписаться. Еще больше интересных и полезных статей вы можете прочитать - в нашем канале в Телеграм, и на сайте издательства "МЕДИК" medik.press. Будьте здоровы!
Источник:Weill Cornell Medicine