Евгения Медведева родилась 19 ноября 1999 года в Москве в семье армянского бизнесмена Армана Бабасяна и бывшей фигуристки Жанны Медведевой, рано завершившей карьеру из-за травмы. Мать олимпийской чемпионки работала на студии «Союзмультфильм», где и познакомилась с будущим мужем. Через несколько лет брака супруги развелись, но сохранили хорошие отношения. В фигурное катание Евгению отдали в трехлетнем возрасте. Она занималась в одной из старейших в столице школ фигурного катания при стадионе «Юных пионеров», затем в ЦСКА в группе заслуженного тренера России Любови Яковлевой. Когда девочке исполнилось восемь лет, она попала в группу Этери Тутберидзе, а спустя четыре года вошла в состав сборной России по фигурному катанию. Изначально Медведева тренировалась под фамилией Бабасян, однако позже взяла девичью фамилию бабушки по материнской линии. Дебют фигуристки состоялся в 2013 году на этапе Гран-при среди юниоров в Латвии, где юная спортсменка завоевала золото. Затем последовали победы на