Иноческая жизнь не прекращалась в монастыре святой Екатерины, начиная с момента его основания. Обители покровительствовали главный духовный лидер ислама Мухаммед, арабские халифы, турецкие султаны, рыцари-крестоносцы и Наполеон Бонапарт, благодаря чему ее ни разу не разорили.
Монастырь расположен в центре Синайского полуострова, рядом с горой Синай (Хорив), на высоте полутора километров над уровнем моря. Живут там, в основном, греки.
Именно на вершине Хорива Бог дал пророку Моисею десять ветхозаветных заповедей. Сейчас там находится часовня Пресвятой Троицы со святыней внутри – камнем, из которого пророк вытесал скрижали, на коих перст Божий начертал основу ветхозаветного религиозного закона. Святыня находится на высоте более двух километров над уровнем моря. К ней ведут две дороги – Лестница покаяния из 3750 ступеней, вырубленная в скале, и проложенная в XIX веке, более легкая, Верблюжья тропа.
Отшельники стали селиться здесь небольшими группами или поодиночке с III века. По праздникам все обитатели святого места собирались возле Неопалимой Купины для богослужений.
В 330 году царица Елена – мать императора Константина Великого – велела построить рядом с Неопалимой Купиной храм в честь Богородицы, а также башню-укрытие.
Царь Юстиниан I в VI веке построил вокруг монастыря мощные стены. В помощь монахам Юстиниан переселил на Синай двести семей из Понта Анатолийского и Александрии. Эти люди – предки бедуинского племени джабалия, которое до сих пор живет вокруг Хорива и обслуживает монастырь.
В VII веке, когда началось арабское завоевание, некоторые монахи отправились в Медину и получили от Мухаммеда охранную грамоту, копия которой ныне является экспонатом монастырской иконной галереи.
В XI веке мусульмане построили в монастыре мечеть, существующую до сих пор.
В эпоху крестовых походов (XI-XIII вв.) монахов и паломников оберегали рыцари Синайского ордена. В этот период в монастыре построили католическую часовню. Когда в 1517 году турецкий султан Селим I завоевал Египет, он предоставил местному архиепископу особый статус.
Первые названия обители – "монастырь Преображения" и "монастырь Неопалимой Купины". В середине VI века синайские монахи обрели мощи великомученицы Екатерины, а в XI веке святую стало почитать великое множество людей. С тех пор обитель приобрела свое окончательное название.
Игумен монастыря святой Екатерины – архиепископ Синайский. С VII века владык рукополагают Иерусалимские патриархи.
Каждый день после службы Часов монахи открывают паломникам доступ к мощам великомученицы Екатерины.
Католикон – главный храм монастыря, построенный Юстинианом, – это базилика в честь Преображения Господня. В алтаре есть мраморная рака с двумя серебряными ковчегами, в которых находятся честная глава и десница святой Екатерины. Перст великомученицы всегда открыт для почитания и находится в мощевике на иконе святой в том же храме.
За алтарем базилики находится древняя часовня – в том месте, где Бог открылся Моисею. Как Бог велел пророку снять обувь в святом месте, так и паломники по сей день разуваются, входя в часовню.
Престол стоит над корнями Неопалимой Купины, а куст когда-то пересадили несколько дальше здания. Само первоначальное место Купины видно всем посетителям из-под престола. Каждую субботу в святилище служат Литургию.
Всего же в монастыре святой Екатерины двенадцать часовен.
В эпоху исхода евреев из Египта на горе жил мадиамский жрец Иофор (Рагуил). Семь его дочерей однажды встретил Моисей, когда покинул Египет и пришел на полуостров в возрасте сорока лет. Дочери Иофора поили тогда скот водой из источника (колодца), который до сих пор существует неподалеку от монастырского храма.
Моисей женился на одной из сестер (Сепфоре) и сорок лет пас стада Иофора. После этого Бог явился пророку в Неопалимой Купине, и велел вывести евреев из Египта, а потом привести их к Хориву.
Шестьсот лет спустя на Синае от злобной царицы Иезавели прятался Илья-пророк. Вокруг пещеры Илии построена часовня в честь пророка.
Кладбище и оссуарий находятся за монастырскими стенами. Семь из всех могил кладбища – многоразовые. Из них периодически извлекают кости иноков, которые потом помещают в оссуарий. В хранилище останков есть полный скелет отшельника Стефана, упоминаемого преподобным Иоанном Лествичником, и скелеты Синайских архиепископов. Черепа же и кости остальных подвижников складывают в оссуарии раздельно.
В монастыре святой Екатерины хранится очень много древних икон и рукописей. Библиотека обители сравнима по исторической важности лишь с Апостолической библиотекой Ватикана. Языки документов – греческий, арабский, сирийский, грузинский, армянский, коптский, эфиопский и славянский.
В обители исследователям доступны следующие исторические реликвии: более трех тысяч манускриптов; более полутора тысяч свитков; около пяти тысяч книг, созданных на заре эпохи книгопечатания; грамоты с золотыми и свинцовыми печатями византийский царей, патриархов и турецких султанов.