Потребность в установлении маяков в Заполярье появилась ещё в 19-ом веке и была связана с активным освоением Арктики и северных морей. Вначале появлялись навигационные знаки ввиде деревянных и каменных возвышений. На берегу рыбаки раскладывали большой костёр, который в тёмное время помогал им вернуться на берег. В узких местах проходы для кораблей обозначали плавучими бочками, закреплёнными на якорях. На острове Кильдин первые навигационные знаки появились в конце 19-го века с восточной и западной стороны, для входа в Кильдинский залив. В северной же части острова, где под водой прячутся рифы, первый временный маяк был установлен в 1931 году. Его собирались заменить на капитальное сооружение, но война помешала. Северный Кильдинский маяк из бетона построили в 1953 году. Недалеко появился посёлок, метеостанция и военая часть. В 90-е годы не стало на острове посёлка, военной части и поддерживать работу маяка было сложно. В 1997 году маяк оборудовали радиоизотопными батареями, обесеч