Найти тему

Международный институт исследований риса представил новую панель для селекционеров этой культуры

   Международный институт исследований риса представил новую панель для селекционеров этой культуры
Международный институт исследований риса представил новую панель для селекционеров этой культуры

Международный институт исследований риса (IRRI) представил новый ресурс — панель выпущенных сортов (RVP), которая включает более 130 секвенированных сортов риса. Выпуск этого нового набора, организованный отделом инноваций в области селекции риса IRRI, направлен на повышение осведомленности и использования типов растений и генотипов улучшенных сортов риса, выращиваемых фермерами-рисоводами. К ним относятся типы риса, которые популярны в определенных странах, или более устойчивы к последствиям изменения климата.

Семена доступны по запросу ученых и селекционеров через Международный банк генов риса (IRG), а последовательности доступны в базе данных SNP-Seek.

Благодаря платформам о генотипах риса, таких как High-Density Rice Array (HDRA) и проекту «3000 геномов риса) (3000 Rice Genomes Project (3k RGP)) многие селекционеры культуры, стали ближе к коллекции гермоплазмы/местных сортов IRG, выявив множество ценных признаков/генов/QTL/донорских образцов. Однако признаки растений и аллели современных/улучшенных сортов, разработанных селекционерами, могут отличаться от панелей разнообразия.

Платформа RVP может способствовать связыванию исследований риса в восходящем направлении с путями воздействия. Это может помочь предоставить эталоны для сортов с несколькими полезными признаками. Поскольку многие из образцов в RVP в настоящее время выращиваются фермерами-рисоводами, использование этих линий в качестве эталонов может повысить вероятность того, что результаты исследований в восходящем направлении достигнут фермерских полей.

Финансирование и поддержка разработки RVP и усилий по секвенированию происходят от различных партнеров и спонсоров, включая Фонд Билла и Мелинды Гейтс (BMGF), Фонд семьи Зегар (Нью-Йоркский университет), Китайскую академию сельскохозяйственных наук (CAAS) и правительство Шэньчжэня, Китай. Crop Trust оказал поддержку в поддержании коллекций семян Genebank.

Чтобы получить доступ к списку RVP и описаниям образцов на платформе Genesys, вы можете инициировать запрос семян, нажав «Добавить в мой список» и «Запросить материал» и введя свои данные. Альтернативный способ скоро будет доступен через платформу GRIN-Global. Семена можно запросить, создав профиль, выбрав «поиск по списку», перечислив набор RVP образцов (номера IRGC 141079-141216) и отсортировав предпочитаемые семена.

Для обработки запроса на семена уполномоченное лицо в вашей организации должно согласиться со стандартным соглашением о передаче материалов (SMTA), разрешением на импорт и фитосанитарным сертификатом. В зависимости от вашей страны/организации вас могут попросить внести платеж, чтобы помочь покрыть расходы, связанные с Genebank. После выполнения всех требований запрос на семена будет обработан, что может занять около шести недель с момента заказа до отправки.

Наборы SNP (полиморфизмы отдельных нуклеотидов) можно найти в базе данных SNP-Seek International Rice Informatics. Наборы SNP для каждого выпущенного сорта в настоящее время распределены по различным наборам сортов или файлам для загрузки, но будут объединены в один общий набор данных после выпуска версии SNP-Seek 3.

Другая доступная информация о Released Variety Panel — это некоторые фенотипические данные Zenodo, открытом репозитории исследовательских данных. Эти фенотипические данные были получены студентами-стажерами с их руководителями IRRI в рамках программы исследовательского опыта, координируемой Университетом Пердью и поддерживаемой Национальным научным фондом International Research Experiences for Students (NSF-IRES). По вопросам, связанным с SNP-seek, обращайтесь по адресу iric@irri.org.

Источник и фото: IRRI.

Оригинал статьи на AgroXXI.ru

Интересна тема? Подпишитесь на наши новости в ДЗЕН | Канал в Telegram | Группа Вконтакте | Дзен.новости.