Статья подготовлена изданием Лаборант - журнал об аналитической химии. Подписывайтесь так же на наш телеграм-канал о научных новостях Генетика и Геномика.
Ученые использовали богатство протеомных, геномных и молекулярных данных для создания интерактивного онлайн-инструмента, который отображает некоторые сложности человеческой физиологии и болезней. Этот визуальный инструмент называется Connecting Omics (COmics), и он может использоваться для запросов о различных признаках и заболеваниях. Исследователи основывали этот метод на анализе крови, мочи и слюны почти 400 человек. Результаты были опубликованы в журнале Nature Communications.
Физиологические процессы включают широкий спектр взаимодействий между различными молекулами, включая ДНК, РНК и белки. Эти отношения могут зависеть от типа клетки, ткани или органа. Это исследование сосредоточено на данных за двенадцать лет от пациентов с диабетом и здоровых людей разных этнических групп, так что, хотя оно и охватывает только часть разнообразия и аспектов человеческой биологии и болезней, оно демонстрирует, как технологии могут использоваться для проверки гипотез о человеческих заболеваниях.
"Наша идея заключалась в том, чтобы объединить все, что мы узнали за более чем десятилетие исследований в области мультиомики, чтобы создать комплексную молекулярную модель человеческого тела и его процессов", — сказал старший автор исследования доктор Карстен Зухре, профессор Weill Cornell Medicine в Катаре (WCM-Q), среди прочих назначений. "Этот справочный инструмент бесплатен для доступа и использования исследователями, которые хотят исследовать, как работает человеческое тело на молекулярном уровне, а также для формирования гипотез для проверки с помощью экспериментов."
Образцы крови, мочи и слюны, собранные у здоровых людей и больных диабетом, были проанализированы различными способами. Это включало анализы экспрессии генов, эпигенетические исследования, протеомные техники, оценивающие белки, и метаболомные тесты, фокусирующиеся на таких молекулах, как аминокислоты, жиры и сахара. Исследование изучило более 6000 молекулярных данных.
Эта работа раскрыла различные пути и связи между генетическими особенностями и белками, метаболическими характеристиками и молекулярной дисфункцией. Данные были интегрированы в веб-сайт Connecting Omics (COmics) для картирования молекулярного человека.
Этот так называемый мультиомный подход используется с возрастающей частотой и стремится рассматривать биологические процессы вместе, а не фокусироваться на отдельных чертах, чтобы больше узнать о здоровье, заболеваниях и потенциальных методах лечения.
"Наш интегративный омный подход предоставляет обзор взаимосвязей между различными молекулярными признаками и их ассоциацией с фенотипом человека — его наблюдаемыми признаками, такими как внешний вид, биохимические процессы и поведение", — сказала первый автор исследования доктор Анна Халама, доцент WCM-Q. "Масштаб данных, интегрированных в веб-инструмент COmics, позволяет доступ к сотням тысяч путей и ассоциаций для исследования исследователями, давая огромный потенциал для открытий и исследований."
Источники:
1. Weill Cornell Medicine
2. Nature Communications
Статья подготовлена изданием Лаборант - журнал об аналитической химии. Подписывайтесь так же на наш телеграм-канал о научных новостях Генетика и Геномика.