Родился будущий мэтр японской анимации в городе под Токио в 1941 году в семье заведующего фабрикой комплектующих для самолетов. Летательные аппараты от того часто фигурируют в его работах.
Не смотря на любовь к рисованию, проявившуюся еще в детстве, Хаяо поступил в университет Гакусюин, который выпускал руководящие кадры страны, и изучал экономику и политику.
Насмотревшись в детстве на ужасы войны, получив блестящее образование в сфере политологии, Хаяо чувствовал ненависть к фашистам и симпатию к коммунистам и марксистам.
Пропаганда против войны прослеживается в его творчестве, полном умиротворения и добра. После университета Хаяо устроился на крупнейшую анимационную студию Toei Animation в роли подмастерья, попутно отрисовывая свою мангу. Долгое время работал на сторонних проектах, пока однажды с коллегой Исао Такахатой не отправился в вольное плаванье. Так в 1979 году на свет появилась самостоятельная работа уже признанного к тому моменту аниматора Хаяо Миядзаки «Люпен ||| Замок Калиостро».
