Найти в Дзене

6. Онтология в информатике и биоинформатике

Понятие онтологии первоначально философское, согласно Вике: Онтология (новолат. ontologia от др.-греч. ὤν род. п. ὄντος — сущее, то, что существует и λόγος — учение, наука): «Генная онтология» - (Gene Ontology, или GO) — биоинформатический проект, посвящённый созданию унифицированной терминологии для аннотации генов и генных продуктов. Целью проекта является составление аннотаций генов и продуктов, разработка инструментов для работы с базой данных проекта, а также для анализа новых экспериментальных данных, в частности, анализ представленности функциональных групп генов. Стоит отметить, что в проекте GO был создан язык разметки для классификации данных (информации о генах и их продуктах, то есть РНК и белках, а также их функциях), который позволяет быстро находить систематизированную информацию о продуктах генов. «Генная онтология» является частью более масштабного проекта по классификации — «Открытые биомедицинские онтологии» (OBO). Но вернёмся в информатику, просто информатику. Онтол

Понятие онтологии первоначально философское, согласно Вике:

Онтология (новолат. ontologia от др.-греч. ὤν род. п. ὄντος — сущее, то, что существует и λόγος — учение, наука):

  • Онтология — раздел философии, изучающий проблемы бытия.
  • Онтологияв информатике попытка всеобъемлющей и детальной формализации некоторой области знаний с помощью определённой концептуальной схемы.

«Генная онтология» - (Gene Ontology, или GO) — биоинформатический проект, посвящённый созданию унифицированной терминологии для аннотации генов и генных продуктов.

Целью проекта является составление аннотаций генов и продуктов, разработка инструментов для работы с базой данных проекта, а также для анализа новых экспериментальных данных, в частности, анализ представленности функциональных групп генов. Стоит отметить, что в проекте GO был создан язык разметки для классификации данных (информации о генах и их продуктах, то есть РНК и белках, а также их функциях), который позволяет быстро находить систематизированную информацию о продуктах генов.

«Генная онтология» является частью более масштабного проекта по классификации — «Открытые биомедицинские онтологии» (OBO).

Но вернёмся в информатику, просто информатику.

Онтологии используются в программировании как форма представления знаний. Обычно они состоят из экземпляров (instances), понятий (concepts), атрибутов (attributes) и отношений (relationships).

Язык описания онтологий — формальный язык, используемый для кодирования онтологии. Существует несколько подобных языков - Web Ontology Language - OWL, Knowledge Interchange Format - KIF и др. Для работы с языками онтологий существует несколько видов технологий: редакторы онтологий (для создания онтологий), СУБД онтологий (для хранения и обращения к онтологии) и хранилища онтологий (для работы с несколькими онтологиями).

Онтологии в искусственном интеллекте (ИИ) используются для нескольких ключевых целей:


1.
Структурирование знаний: Онтологии помогают организовать и структурировать информацию, определяя понятия, их свойства и взаимосвязи. Это позволяет создать четкую модель предметной области.

2.
Улучшение семантического поиска: Онтологии позволяют системам лучше понимать контекст и смысл запросов, что улучшает качество поиска и извлечения информации.

3.
Интероперабельность: Использование онтологий обеспечивает совместимость между различными системами и источниками данных, позволяя им обмениваться информацией на основе общего понимания терминов и понятий.

4.
Поддержка reasoning (выводов): Онтологии позволяют системам делать логические выводы на основе заданных правил и отношений, что открывает возможности для автоматизированного принятия решений.

5.
Обогащение данных: Онтологии могут использоваться для аннотирования данных, добавляя семантическую информацию, что помогает в дальнейшем анализе и интерпретации данных.

6.
Упрощение разработки ИИ-систем: Онтологии предоставляют стандартизированные модели, которые могут быть использованы для разработки различных приложений в области ИИ, таких как системы управления знаниями, экспертные системы и чат-боты.

7.
Поддержка машинного обучения: Онтологии могут помочь в формировании признаков для алгоритмов машинного обучения, обеспечивая более точные и значимые входные данные.

▎Примеры применения:

-
Медицинские системы: Онтологии используются для моделирования медицинских знаний, что помогает в диагностике и лечении.
-
Системы управления контентом: В таких системах онтологии помогают организовать и классифицировать информацию.
-
Чат-боты и виртуальные ассистенты: Они используют онтологии для понимания запросов пользователей и предоставления релевантных ответов.

Таким образом, онтологии играют важную роль в создании более интеллектуальных и эффективных ИИ-систем.