В ходе Войны за независимость Греции её идеологи, в основном люди из диаспор, получившие западное образование, пропагандировали отказ от самоназвания римляне и возвращение к древнему этнониму эллины. Они порицали Византию за то, что она не смогла защитится от османского завоевания и называли её чуждым эллинизму государством, периодом упадка и деградации эллинского народа.
Справедливости ради, простые повстанцы и полевые командиры не сразу восприняли этот подход. Теодорос Колокотронис, один из наиболее видных генералов повстанческой армии, говорил английскому капитану Гамильтону, что не согласен капитулировать перед турками, потому что «наш василевс не заключал договора».
Ну а после завершения войны в 1829 г. и создания независимого Греческого королевства в 1832 г. началось становление нового государства - а вместе с тем национальных историографии и системы образования.
Одним из первых новых историков современного типа в Греции стал афинянин Кириакос Паттакис (1798-1863) начал заниматься археологией еще при туркократии. Изучение древней истории потрясло его и привело к вступлению в Филики Этерию в 1816 г. Он не был кабинетным ученым - участвовал в освобождении Афинского Акрополя в 1822 г., и именно во время осады приступил к систематическому изучению Акрополе и в 1830-е гг. стал основателем современной археологической службы Греции.
Его критикуют за пуризм, в рамках которого он добивался сноса всех сооружений, возведенных на Акрополе после IV в., в особенности Тосканской (или Франкской) башни, построенной в период правления в Афинском герцогстве тосканской семьи Аччайоли (1388-1458), сменившей Наваррскую компанию (которая в свою очередь сменила Каталанскую компанию). Башня была снесена уже после его смерти, в 1875 г.
Но надо учесть - в рамках дискурса зарождающейся научной археологии XVIII-XIX вв. воссоздание "исконного" вида памятника истории и культуры было приоритетнее, чем сохранение всех культурных слоёв. Так или иначе, актуальным обликом Акрополя мы обязаны именно Паттакису.
Но на теоретическом уровне наибольшее влияние на этапе формирования научной традиции имел Стефанос Куманидис (1818-1899), уроженец Адрианополя, росший после 1821 г. в Белграде и учившийся в Мюнхене и Париже. Оттуда он приехал в 1845 г. в Грецию и вскоре стал профессором латинской филологии в Афинском университете (и в частности составил эллино-латинский словарь).
В Германии он часто сталкивался с теорией о том, что древние эллины вымерли, и их место заняли албанцы и славяне, впоследствии огреченные. В противоположность ей он наиболее полном и последовательном виде сформулировал теорию, в рамках которого новая Эллада выводилась напрямую из древней, а Византия противопоставлялась ей. Этот взгляд пользовался особенным расположением властей в период правления василевса Оттона Баварского (1832-1862). В связи с этим он был горячим сторонником кафаревусы - пуристской версии греческого языка, максимально приближенной к аттическому койнэ эллинистического периода.
Первым реабилитировать византийское наследство взялся Димитриос Скарлатос (1798-1878). Он родился в Яссах, столице Молдовы (ныне Румыния) в семье выходцев из Константинополя. В 1821 г. его семья бежала из Молдовы во время резни греков, устроенной турками в румынских княжествах, в Австрию. Димитриос учился в Париже и в 1830 г. с семьей переехал в уже независимую Грецию. Он служил чиновником, активно участвовал в политической жизни нового государства, но более всего известен стал как историк и лингвист. В 1835 г. создал словарь новогреческого, в 1846 - франко-греческий (Λεξικόν Ελληνικόν και Γαλλικόν), а в 1851 - словарь древнегреческого. Но наиболее заметной стала его работа 1852 г. "Константинополь", опубликованная под псевдонимом Византиос (Βυζάντιος). В ней он впервые реабилитировал Византийскую империю, указывая на неё как на неотьемлимую часть национальной истории, и положил начало греческой научной византиистике.
Константинос Папаригопулос (1815-1891) родился в Константинополе, его отец был банкиром, выходцем из южногреческой Аркадии, а мать же была боспоритиссой - коренной уроженкой Города. Его родители были казнены по обвинениям в связях с "Филики Этерия", а имущество конфисковано во время греческих погромов 1821 г. Он иммигрировал в Россию, учился в Ришельевском лицее, в 1833 г. приехал в Греческое королевство, где служил в министерстве юстиции и в сфере образования. В 1853 г. издал "Историю греческой нации с древнейших времен и до новейших", где доказывал, что именно Византия является связующим звеном между древними и современными эллинами.
Этот подход стал набирать популярность после либеральной революции 1862 г., свергшей Оттона, и восхождения на трон династии Глюксбургов, и особенно к концу XIX века, когда на горизонте забрезжил шанс овладеть центральными регионами былой Византии, включая сам Константинополь. В результате к 1890-м произошел синтез византистского и элинистского подходов в национальной историографии и самосознании, выразившийся в Великой Идее восстановления Византии уже как греческого государства - Μεγάλη Ιδέα. Ярким представителем эллино-византистского синтеза и поборником Мегали Идеи стал критский политик Элефтериос Венизелос (1864-1936).
Этот националист, либерал и республиканец составил целую эпоху в новогреческой истории, возглавив сначала борьбу за воссоединение Крита с Элладой в 1895-97 гг., возглавлял автономный Крит в составе Османской империи в 1898-1912 гг., а затем был премьер-министром всей Греции с перерывами в 1910-20 и 1928-33 гг.
В период успешных Балканских войн 1912-1913 гг. его мысль приобрела имперский размах: "Греческие мусульмане должны быть связующим звеном между Грецией и мусульманами других стран, поскольку последние будут отделены от Османской империи. Греции следует подумать о том, чтобы завоевать доверие балканских мусульман путем предоставления политических прерогатив... Греческое Королевство будет расширяться к северу за счет масс нового мусульманского населения... В этом отношении Греция станет, среди прочего, мусульманской державой, как Россия или Англия. Греция, в силу своего исторического прошлого и ее связей с мусульманами, однажды станет мусульманской державой, в которой мусульмане будут жить довольными."
С ним связаны победы в Балканских войнах и Первой мировой, а с его отрешением от власти - поражение монархистов в греко-турецкой войне 1919-22 гг. с последующим разрушением сердцевины наследия Византии - православных общин Константинополя и Малой Азии.
После создания Турецкой республики турецкая историография в отношении к Османской империи с лагом почти на 100 лет прошла путь аналогичный трансформации новоэллинского восприятия Империей Ромеев. Сначала, особенно в период классического кемализма 1925-1950 гг. - подчеркнуто негативное отношение к Османской империи как государству, в котором тюрки не имели значения, аппеляции к сельджукскому прошлому и прошлому тюрок до завоевания Анатолии, а вместе с тем и фольхисторические попытки записать в турки индоевропейцев-хеттов. Но после празднования 500-летия завоевания Константинополя в 1953 г. начался процесс реабилитации османского наследия, перешедший в 1980-е гг. в "тюрко-османский синтез", венцом которого стал Реджеп Эрдоган.