Систематика лошадей спорна. По наиболее распространённым взглядам, род лошадей состоит из нескольких вымерших и 9 современных видов:
- Дикая лошадь (Equus ferus)
- Домашняя лошадь (Equus caballus)
- Кианг (Equus kiang)
- Кулан (Equus hemionus)
- Дикий осел (Equus africanus)
- Домашний осел (Equus asinus)
- Горная зебре (Equus zebra)
- Пустынная зебра (Equus grevyi)
- Бурчелова зебра (Equus quagga)
- Западная лошадь — вид, обитавший в Северной Америке, и вымерший в конце плейстоцена
- Ленская лошадь (Equues Lenus)— существовала в позднем плейстоцене — начале голоцена Сибири. Найденные остатки этого ископаемого вида в Якутии (2011 год) датируются радиоуглердоным возрастом 4630 лет до настоящего времени (середина голоцена)
- Лошадь Стенона — существовала в плиоцене — начале плейстоцена Евразии
- Equus oldowayensis — вымерший вид зебры, существовал в плиоцене — начале плейстоцена в Восточной и Южной Африке.
Насчёт этой классификации существуют некоторые расходящиеся мнения. Осла и кулана иногда выделяют в отдельный род Asinus, аргументируя тем, что эти два вида отделились от остальных в плиоцене. Лошадь Пржевальского и домашняя лошадь обычно считаются двумя разными видами из-за разного количества хромосом. Иногда первых всё же причисляют к домашней лошади. По данным палеогенетиков, лошади Пржевальского являются одичавшими потомками ботайских лошадей.
Куланы делятся на ряд подвидов, которые некоторые зоологи рассматривают самостоятельными видами. В зависимости от точки зрения существуют до семи видов куланов. Некоторые зоологи предпочитают делить равнинных зебр на бурчелловых зебр (Equus burchellii) и квагг (Equus quagga quagga). Три вышеперечисленных вида зебр иногда объединяют в общий подрод зебры, который, однако, является условным, так как родство между этими тремя видами не более тесное, чем по отношению к другим видам.