Сюжет фильма «Операция „Ы“ и другие приключения Шурика» включает три самостоятельные новеллы, объединённые главным героем — оптимистичным и находчивым студентом Шуриком:
«Напарник». Дело разворачивается на стройке. Туда попадает великовозрастный дебошир и пьяница Федя, получив 15 суток административного наказания за драку в автобусе. Пострадавшим в этой драке и «сдавшим» Федю милиции оказывается Шурик, который подрабатывает на той же самой стройке. «Наваждение». Шурик готовится к важному экзамену в институте. У героя не оказывается необходимых лекций для подготовки, и он ищет материал у всех знакомых, но находит его у совершенно незнакомой девушки Лиды. «Операция „Ы“». Шурик подменяет хозяйку своей квартиры, милую старушку на её посту охранника торговой базы. Однако герой не знает, что именно в эту ночь готовится крупное ограбление. В итоге тщательно продуманная и отрепетированная операция срывается из-за находчивости и смелости Шурика.