Калязин впервые упоминается в летописях XII века как слобода на реке Жабня, которая впадала в Волгу. В 1434 году слобода стала собственностью мужского Троицкого Калязинского (Макарьевского) монастыря. В 1775 году Екатерина II присвоила Калязинской слободе статус уездного города, но Павел I в 1796 году отменил этот указ, выразив таким образом своё отношение к правлению матери. Статус города Калязину вернул Александр I в 1803 году.
В 1939–1940 годах при строительстве Угличской ГЭС две трети города Калязина, где находились архитектурные и исторические памятники, были затоплены.
Колокольня, построенная в 1800 году при Николаевском соборе (возведённом в 1694 году), осталась на поверхности как маяк. К монастырю вела мощёная улица, частично сохранившаяся до наших дней. Перед монастырём располагалась торговая площадь, где собирались купцы и крестьяне.
В советское время колокольню хотели снести из-за небольшого наклона, вызванного непрочностью фундамента, но в конце 1980-х годов фундамент колокольни укрепили, вокруг неё создали искусственный остров с причалом для лодок.
В 2021 году колокольню отреставрировали, восстановив шпиль, крест и фасады, часы с боем, кованые решётки и окна, а также смонтировав подсветку фасадов.