Пока без воскрешения, но больше сведений о геноме мамонтов они получили!
В одной из недавних работ исследователи анализировали образцы кожи
головы шерстистого мамонта (в районе Белой Горы, Республика Саха,
Сибирь) позднего плейстоцена. Образец сохранился крайне хорошо, так как
эти останки подверглись процессу стеклования (одновременная заморозка и
потеря влаги при низких температурах). Углеродное датирование показало,
что данный мамонт жил более 45000 лет назад, а анализ митохондриальной
ДНК показал 52000 лет.
Учёные решили исследовать 3D-структуру генома (произвести картирование
контактов хроматина, сборку генома, а также попробовать определить
хромосомные территории, компартменты, петли, тельца Барра, а также
неактивные супердомены Х-хромосомы (Xi)).
Изучение древней ДНК (aDNA) началось с секвенирования фрагментов
митохондрий. Современные палеогеномные анализы включают
секвенирование ДНК целых геномов (aDNA-Seq) множества вымерших и
архаичных людей, животных, растений и патогенов. Однако, учитывая
фрагментарную природу типичных молекул aDNA, такие анализы основаны
на сопоставлении коротких считываний с современным эталонным
геномом. Это позволяет идентифицировать однонуклеотидные
полиморфизмы (SNP).
Для реконструкции 3д-структуры генома была использована
модифицированная версия метода Hi-C – PaleoHi-C. В ходе работы было
выявлено, что древняя конформация хромосом сохраняется в образце
мамонта, а разработанный метод может анализировать подобные данные.
Учёные смогли определить, что у шерстистых мамонтов было 28 пар
хромосом (что связывает их с современными представителями данной
группы). Также было показано, что в исследуемых образцах сохранялись
морфологические особенности данных хромосом (их архитектурные
особенности). Для Xi было выявлено, что у шерстистого мамонта данная
структура обладает тетрадной архитектурой, как и у современных слонов (у
человека и мыши, например, двухчастная (bipartite)).
В совокупности результаты исследовательской группы раскрывают новые
подходы к изучению архитектуры генома, эпигенетики и экспрессии генов в
древних образцах и позволяют работать в сфере создания de novo сборки
генома древних и вымерших видов. Они также демонстрируют, что
морфология древних биообразцов может хорошо сохраняться в масштабах до
50 нм.
