Джейк Салли - некогда морпех, после ранения остался инвалидом. Потеряв всё, герой чувствует себя изолированным от всех людских сообществ. Государство, на благо которого он положил здоровье и благополучие, списало его, как просрочку. Семьи у него нет. Он всячески отрицает свою немощность, часто выбирается в люди. Но люди вокруг никак не скрашивают его одиночества, они лишь делают Джейка одиноким в толпе. Но герой не отчаивается, не опускается до жалости к себе. В клубе, полном здоровых увальней, только Джейк встаёт на защиту девушки, которую избивает её кавалер, за что его и вышвыривают в лужу под дождь, кинув коляску прямо на больные ноги. В этот момент герою подходит группа людей в штатском. Джейка оповещают, что единственный, оставшийся у него близкий человек - его брат близнец погиб от руки уличных воров. Но брат Джейка всегда тяготел к науке, потому в порядке государственной тайны был направлен на важное задание по освоению недавно обнаруженной планеты в 5 годах космического полёта от земли. Для того, чтобы без проблем передвигаться и вливаться в сообщество населения Пандоры, корпорация RDA решила выращивать аватаров. Гигантские синие тела, могущие вместить сознание человека и дать ему возможность дышать в атмосфере Пандоры.
Действие происходит в середине 22 века, человечество находится в красной зоне опасности. Практически все природные ресурсы исчерпаны, планета перенаселена.
Аватар, выращенный для брата-близнеца Джейка, подойдёт и для самого Джейка потому, что они генетически идентичны.
Джейк не горит желанием заниматься наукой, он убежден, что он лишь солдат, но соглашается помочь якобы науке в лице корпорации, чтобы получить деньги на лечение. Задание героя - втереться в доверие к кому-то из местных, чтобы поспособствовать их перемещению с богатой минеральными ресурсами земли, а если это не получится сделать мирным путём, добыть стратегически важную информацию для дальнейших военных действий.
Наш герой, как ребёнок, взаимодействует с местным миром без страха и с раздражающей окружающих гиперактивностью. Однако его талант влезать в неприятности сводит его с Нейтири - охотницей из местного племени на’ви. Девушка спасает Джейка от хищника, семена Священного дерева выбирают Джейка, а Нейтири чувствует в нём доброе сердце и, несмотря на то, что люди убили её сестру, как позже выяснится, отводит Джейка к своим. У народа Нейтири очень тесна связь с природой, они также получают некий знак, чтобы оставить Джейка и научить всему. Нейтири поручают обучить его всему, она поначалу очень недовольна учеником, но в процессе взаимодействия они с Джейком начинают влюбляться друг в друга. Проводя свои дни на Пандоре, Джейк наконец чувствует себя причастным.
Причастным к племени, к природе. В видеодневник, который ведёт Джейк, попадает уже не всё, а жизнь в своём теле ощущается какой-то досадной галлюцинацией. Главный в корпорации говорит Джейк, что его пребывание на Пандоре подходит к концу, но Джейк заявляет, что грядущая церемония посвящения даст им гораздо больше.
Племя не откажется от святой земли предков, а потому, вскоре надвигается наступление. Многие сотрудники корпорации прикипели к людям на’ви, они поднимают восстание, попадают за решётку. В конце добро побеждает, другого быть не могло, ведь приходя на чужую землю, дабы эксплуатировать там то, что вы не хотели правильно распределять до этого, стоит рассчитывать, что вы, будучи м*даком, понесёте соответствующее наказание. Но так ли это? На самом деле Аватар - важное социальное высказывание. Оно обращено и к американскому правительству (которое славится бессмысленными войнами с менее технически развитыми странами) и к населению земли, противопоставляя не особо отличающийся от сегодняшнего ландшафт серых урбанистических зданий яркому насыщенному миру Пандоры, мало чем отличающемуся от видов девственной природы земли. Так авторы призывают нас беречь природу. А Джейк - герой, в котором себя может узнать каждый. Он достойно проходит житейские тяготы и достигает всех своих целей, делая правильные выборы.