Три года назад на планете Земля возник смертоносный вирус, уничтожающий разнообразие растений, что способно вызвать драматичное уменьшение уровня кислорода в атмосфере и привести к гибели всех живых организмов. Однако у человечества остается шанс на спасение благодаря реализации проекта доктора Стивена Росса, который базируется на открытиях, сделанных археологами несколько лет назад. Тогда были обнаружены два таинственных артефакта, созданные неизвестной цивилизацией более четырех миллиардов лет назад. Происхождение этих артефактов до сих пор неизвестно, однако они появились как нельзя более кстати. Человечество удалось воспроизвести технологию гиперпространственного двигателя, что позволяет перемещаться на сотни световых лет, благодаря чему была найдена планета Тес, идеально подходящая для колонизации. Второй артефакт, таинственная сфера, способна производить живую материю и, при правильных настройках, воссоздавать экосистему Земли. Ученые разгадали множество команд, каждая из которых соответствует определенному узору. Стивен демонстрирует ключевую команду, которую сфера начала исполнять около четырех миллиардов лет назад.
Создание чуда. Жизни. Доктор представляет команду, отправляющуюся на новую планету. В составе команды Питер, специалист по гиперпространственному двигателю, Леона Редвуд, разработчик программы терраформирования, и группа астронавтов под руководством майора Райана. Их задача — доставить на планету Тес сферу, которая начнет создавать условия, подходящие для жизни человека, и помочь обустроить новую Землю. Перед посадкой в космический корабль Стивен вспоминает свою возлюбленную, не зная, что она спешит на космодром, чтобы попрощаться с ним, но успевает увидеть только исходящее из шлюзов пламя корабля, уносящего людей в космос. Во время полета ученые продолжают исследования, стараясь выяснить, где сейчас находятся создатели этих чудес разума. Наступает момент для совершения гиперпрыжка, и экипаж занимает свои места. Капитан Райан отдает команду о готовности, Питер вводит координаты, и корабль пронзает пространство. Но вдруг происходит нечто, от чего экипаж теряет сознание. Придя в себя, они пытаются понять, где они находятся, ведь звездные карты не совпадают.
Стивен немедленно конфронтацию с Питером, утверждая, что тот допустил ошибку с координатами. Игнорируя попытки Питера оправдаться, Стивен исключает его из числа пилотов и посылает в каюту. Стремясь разобраться в произошедшем, Стивен вспоминает момент в пещере, когда он ввел на сфере определенную команду и увидел перед собой светящийся образ. Он просит восстановить траекторию прыжка, однако и она не дает понимания, куда занесло корабль. В этот момент поступает известие об открытии шлюза, а через минуту через иллюминатор люди видят замерзшее тело Питера. Теперь у них нет специалиста по двигателям. Вдруг Стивена осеняет — а какая же планета находится перед ними? Он требует информацию от зондов и, анализируя данные, понимает, что планета даже лучше Тес. Несмотря на возражения Райна, он приказывает начать посадку. Космический модуль направляется к планете, но из-за неблагоприятных погодных условий корабль сильно трясет. В это время Стивен вспоминает, как перед полетом подарил Эмми браслет, сделанный из фрагмента древней сферы. Ричард проводит диагностику модуля.
Он обнаруживает, что модуль почти не поврежден, однако топливо исчерпано. Вернуться на главный корабль будет сложно, но Стивен настаивает на выполнении миссии прежде всего. Отведенная точка оказывается далеко, но поблизости есть пещера, где можно оставить сферу. Команда приступает к работе, не замечая странные желеобразные остатки после сферы. Вскоре они доходят до пещеры и размещают там артефакт. Стивен доволен — условия на этой планете лучше ожидаемых. Тем временем механик осматривает шлюз, где погиб Питер, обнаруживает следы неизвестного вещества и видеокамеру ученого. Стивен активирует сферу, и команда возвращается в модуль, где Ричард демонстрирует запись с камеры Питера. Оказывается, его убило и выбросило в космос некое существо. Это существо, вероятно, вышло из сферы, и его назвали Троян, в честь троянского коня. В это время из пещеры поступают первые данные, которые совсем не соответствуют ожиданиям. Стивен предлагает вернуться в пещеру, но капитан отстраняет его от командования и объявляет военное положение.
И вдруг становится ясно, что монстры могут быть порождением сферы. Отходя, доктор вспоминает момент, когда Дэвид заявил о своем желании присоединиться к экспедиции, несмотря на горечь утраты дочери. Стивен первоначально выступал против участия Дэвида, считая, что ему следует восстановиться после потери, однако Дэвид был решителен в своем стремлении изменить будущее. Поэтому Стивен отправляется к Дэвиду. Им предстоит отправиться в пещеру и изменить настройки сферы, противореча заказу Райана, чтобы спасти Землю. В пещере их ожидает необычная картина: сфера создает иной вид жизни. Очевидно, что кто-то перепрограммировал ее. Тут Дэвид обнаруживает на планшете уведомление о приближении Райана. Но Стивен решает не отступать, не завершив задачу. Дэвид готов применить оружие, но времени уже не остается, монстр находится слишком близко и, по неведомой причине, обходит стороной Дэвида. Мужчины спешат к выходу и с трудом успевают забраться в модуль, где на их пути возникает капитан. Между Стивеном и капитаном вспыхивает конфликт, перераставший в драку. Но внезапно раздается сигнал тревоги: в модуле нарушена герметичность, Троян проник внутрь. Странные звуки будят Леону. Она выходит в коридор и сталкивается с Фрэнком. Они направляются в лабораторию, но обнаруживают, что Троян уже там.
Фрэнк выталкивает Леону наружу, сам же погибает. Девушка бежит на мостик, где выжившие члены экипажа пытаются разобраться, как Троян смог проникнуть в модуль. По всей видимости, существо обладает интеллектом, раз нашло слабое место для проникновения. Теперь необходимо включить резервный генератор, чтобы восстановить освещение и связь. Для этого придется добраться до электрического щитка. Стивен берет на себя эту задачу, чувствуя себя виноватым. Вместе с капитаном они пробираются по коридору, подключают генератор и убегают от монстра. Следующим шагом становится изгнание Трояна из корабля. Стивен предлагает использовать тактику, напоминающую корриду, когда люди привлекают внимание быка, а в завершении разбегаются, оставляя его перед матадором. У модуля два шлюза. Стивен будет ждать монстра у открытого центрального шлюза, а Райан привлечет Трояна к себе, ведя его к Стивену. Дэвид закроет лабораторный шлюз, Стивен останется как приманка снаружи, Леона откроет шлюз в ручном режиме и спрячется в техническом отсеке. Важно, чтобы Троян оказался под соплами двигателя, включив который, они смогут обжечь инопланетную тварь остатками топлива. План почти удается, но когда Троян уже выбегает наружу... двигатели выходят из строя. Троян убегает от корабля, а Леона оказывается под шлюзами, которые в итоге срабатывают. Стивен успевает забраться в шлюз, но Троян ранит Дэвида. Следующей минутой дверь отсекает щупальца монстра.
Люди устраняют утечку. Теперь Троян больше не проникнет внутрь, однако контроль над сферой остаётся за существом. Стивен вспоминает момент, когда Вирус появился в саду у Эмми, и она умоляла его не уходить, ведь они скоро станут родителями. Эмми нашла способ создать вакцину, и вместе они могли бы это сделать, но Стивен чувствовал ответственность за всю планету. Теперь в лаборатории он изучает фрагмент Трояна, пытаясь найти способ излечить Дэвида, и осознаёт, что материалы Трояна идентичны тем, из которых сделана сфера. Они воссоздали материал, не осознавая, кого возрождают. В крови Дэвида обнаруживаются бактерии, которые могут служить вакциной против Вируса, уничтожающего Землю. Стивен вскрывает щупальца существа, и внезапно свет начинает мерцать. Перед Стивеном снова появляется призрачная фигура. Оказывается, это биоробот, которого нужно уничтожить и восстановить настройки сферы, но Райан категорически против возвращения в пещеру. Он запирает лабораторию, утверждая, что Стивену всё равно на людей, для него важнее собственные амбиции. Внезапно Дэвид поддерживает капитана, желая одержать победу даже ценой жизни команды. Оскорблённый этими словами, Стивен вспоминает прощание с Эми, которая отвергла его и выбросила подаренный браслет. Тогда он осознаёт, что фрагмент Трояна — точная копия того отрезка, из которого он сделал браслет. Стивен просит Ричарда смоделировать вид этого сегмента космоса через 4 миллиарда лет. Люди с ужасом осознают, что они переместились во времени, и перед ними Земля до начала жизни на ней. Оказывается, это один и тот же фрагмент сферы, но в разные времена. Значит, некое разумное существо отправило сферу на Землю, но что-то пошло не так, и она начала создавать условия, непригодные для её создателей, но идеальные для человечества.
Стивен должен сообщить Эми о бактериях, способных победить вирус. Он решает написать сообщение на браслете. Хотя она его выбросила, но, скучая, она найдет его и прочитает послание, иначе человечество не возникнет. Всё происходит именно так. Эми приходит в пещеру и вспоминает Стивена, а Райан готовит бомбу, чтобы взорвать пещеру вместе с сферой. Ричард дистанционно открывает шлюз лаборатории, и Стивен бежит за капитаном. Он пытается объяснить Райану то, что они только что узнали о планете, но тот уверен, что единственный способ уничтожить Трояна — взорвать пещеру. Стивен предлагает альтернативный план, но в это время раздаётся выстрел от Дэвида, начавшего преображаться под воздействием бактерий, и Райан падает мёртвым. Дэвид, наконец, понял, что люди — это ошибка. Начинается перестрелка, ведь Дэвид намерен всё исправить. Больше никто не будет страдать, ведь никого не будет. Стивену удаётся ранить Дэвида, который укрывается в коридоре. Доктор активирует бомбу, открывает шлюзы и, выйдя наружу, запускает сигнальную ракету. Потом возвращается в модуль и ожидает прихода монстра. Заманив его внутрь, он закрывает двери, но вдруг появляется Дэвид, и Стив вынужден отстреливаться от бывшего друга. Троян всё же проникает внутрь и нависает над Стивом, но мужчина стреляет в упор и успевает спрыгнуть в люк.
Он мчится к каютам компании, где заложена бомба. Монстр преследует его по верхней палубе. Когда Стив входит в помещение, Дэвид лишает его оружия, но в момент, когда Дэвид собирается выстрелить, Троян уничтожает своего помощника. Стивену удаётся выпрыгнуть из модуля прямо перед тем, как его разрывает взрыв. Ричард с главного корабля пытается связаться с выжившими и получает ответ только от Стива. У него остаётся примерно час. Он направляется в пещеру, чтобы связаться с Эми. Достигнув пещеры, учёный возвращает отколовшийся кусок на место в сфере и вводит необходимый код. Сфера активируется. В это время на Земле начинает идти дождь, и Эми замечает на своём браслете буквы, которые проявляются под действием воды. Она бежит в пещеру и вводит тот же код, и вдруг стены кажутся растворяющимися, и они видят друг друга. Он объясняет, что нужно сделать для победы над вирусом, затем извиняется, поскольку не сможет вернуться. Изображение искажается и исчезает, Эми остаётся одна в своём времени, а Стив — в пещере. Время проходит. Сад Эми расцветает, заживленный, а в центре на коляске плачет младенец. Эми подходит к нему и улыбается ребёнку. Довольно интригующая концепция. В конце концов учёные так и не смогли точно объяснить, откуда взялась жизнь и почему она так многообразна. Возможно, в какой-то пещере до сих пор лежит древняя сфера, продолжающая порождать новые чудеса для человечества? Что думаете?