Исследование, опубликованное в журнале "Microbiome", посвящено сравнению системных антител к жгутикам кишечной микробиоты у пациентов с болезнью Крона (БК) и Синдромом хронической усталости (СХУ). Исследователи использовали метод PhIP-Seq для высокопроизводительного и высокоразрешающего профилирования репертуара антител, что позволило выявить особенности иммунного ответа у этих двух групп пациентов.
Цели и задачи исследования
Основная цель исследования заключалась в выявлении общих и различающихся паттернов антител к жгутикам различных типов (стимуляторные, молчаливые и уклоняющиеся типы) у пациентов с БК и СХУ. Это важно для понимания иммунных механизмов, лежащих в основе этих заболеваний, и для разработки новых подходов к их лечению и диагностике.
Методология
Когорты и сбор данных
- Когорта 1000IBD:Включала 256 пациентов с подтвержденным диагнозом БК.
Данные собирались в рамках проекта 1000IBD в Университетском медицинском центре Гронингена, Нидерланды, с 2007 по 2019 год.
Были собраны фенотипические данные и информация о мульти-омиксах. - Когорта Lifelines-DEEP:Включала данные плазмы от 256 человек, сопоставленных по возрасту и полу с пациентами с БК.
Это популяционное исследование проводилось в северной части Нидерландов и включало более 160,000 человек. - Когорта СХУ и здоровые контроли:Включала 40 пациентов с тяжелыми случаями СХУ и 40 здоровых контролев из биобанка Myalgic Encephalomyelitis Biobank, Великобритания.
Контроли были сопоставлены по возрасту и полу с пациентами с СХУ.
PhIP-Seq процедура
PhIP-Seq используется для профилирования антител с использованием библиотек антигенов. В данном исследовании использовались две библиотеки антигенов, включающие в себя 344,000 антигенов, большинство из которых были микробного происхождения. Это позволило провести подробный анализ связывания антител с жгутиками различных бактерий.
Результаты и обсуждение
Исследование показало, что у пациентов с БК и СХУ наблюдаются как общие, так и различающиеся реакции антител на жгутики. Например, у обоих групп были выявлены антитела, связывающиеся с N-концевыми и C-концевыми участками жгутиков. Однако паттерны связывания антител к различным типам жгутиков (стимуляторные, молчаливые и уклоняющиеся типы) отличались между группами.
У пациентов с БК наблюдались более выраженные антительные ответы на стимуляторные и молчаливые жгутики, что может указывать на активное участие иммунной системы в ответе на бактериальные инфекции. В то же время, у пациентов с СХУ были выявлены специфические антитела к уклоняющимся типам жгутиков, что может свидетельствовать о различной иммунной реактивности и возможной связи с хронической усталостью.
Заключение
Исследование предоставляет новые данные о различиях и сходствах в иммунных ответах у пациентов с БК и СХУ. Эти результаты могут помочь в разработке новых методов диагностики и терапии для этих заболеваний, а также улучшить понимание их патогенеза.
Более детально с исследованием можно ознакомиться на сайте журнала Microbiome (BioMed Central) (BioMed Central) (BioMed Central).