Майкл Скофилд попадает в тюрьму штата Фокс-Ривер в рамках тщательно разработанного плана по освобождению своего брата, Линкольна Барроуза, которому грозит казнь, на электрическом стуле, за убийство брата вице-президента, обвинение, которое Барроуз всеми силами отрицает. Сначала Скофилд, при попадании в тюрьму, вызывает раздражение главного начальника охраны Брэда Беллика, а затем знакомится со своим сокамерником Фернандо Сукре. Майкл вынуждает мафиозника Джона Абруцци завербовать его на тюремные работы, доказав, что знает местонахождение Фибоначчи, единственного свидетеля против Абруцци. Майкл также знакомится с Чарльзом Уэстморлендом, которого считают Д. Б. Купером, и доктором Сарой Танкреди, которая вводит ему инсулин из-за его очевидного диабета, и Бенджамином Майлзом Франклином, который соглашается купить для Скофилда антиинсулиновые препараты. Начальник тюрьмы узнав, что Скофилд был инженером предлагает работу. Скофилд принимает предложение директора Поупа закончить создание модели Тадж-Махала. Скофилд воссоединяется с Берроузом и показывает, что его таинственная татуировка на теле - это схема тюрьмы. Тем временем Л.Дж. Берроуз, сын Линкольна, арестован за торговлю наркотиками. Секретная служба, как выясняется, является частью заговора против Линкольна. Вероника Донован, молодой юрист и бывшая девушка Линкольна, начинает верить в его невиновность.
