В конце XIX века (с 1862 по 1895 год) священником Ильинской церкви был Иван Михайлович Бриллиантов, многочисленная семья которого длительное время проживала в Цыпино и дети которого стали образованными и известными людьми. . Двое его сыновей, Александр и Иван, впоследствии стали специалистами по истории России. В частности, Иван сыграл ведущую роль в исследовании и сохранении художественного наследия Ферапонтова монастыря. К большому сожалению, оба они стали жертвами волны советских репрессий 1930-х годов, направленной против региональных историков. К моменту начала реставрации в июле 2003 года церковь находилась в полуразрушенном состоянии. Верхняя часть храма (два восьмерика из трёх) рухнула в 1960-х годах. Реставрация велась по методу полной переборки, разработанному архитектором-реставратором, лауреатом Государственной премии РСФСР Александром Поповым. Тщательное и методичное воссоздание церкви мастерами-ремесленниками продолжалось все лето 2009 года, после чего памятник был откры