День рождения карантина растений отмечается с 5 июня 1931 года, именно тогда при Народном комиссариате земледелия СССР была создана единая Государственная карантинная служба, и в том же году разработано положение о карантинном контроле над ввозом в страну растительной продукции и живых растений.
В настоящее время полномочия по обеспечению соблюдения законодательства в сфере карантина растений возложены на Россельхознадзор и его территориальные управления.
Фитосанитарный контроль является задачей особой важности по защите территории России от проникновения карантинных и других опасных вредителей, болезней растений и семян сорных растений, которые могут нанести значительный ущерб народному хозяйству.