Что ни день, то новость! Есть гены, определяющие смерть или жизнь при заболевании ковидом.
Ковид прошёлся частым гребнем по популяциям людей. Я до сих пор не могу прийти в себя от смерти сестры от ковида. Она не сделала прививку, заболела, и всё! Поэтому всё, что связано с ковидом, меня задевает за живое.
И вот я узнала потрясающую вещь, когда читала журналы по палеогенетике! Немецкие и шведские исследователи выяснили, что выживание при заражении ковидом зависело от того, какие из последовательностей в 3 хромосоме, мы получили от неандертальцев.
Я не поверила своим глазам и ещё раз прочла все статьи. Сразу скажу надо быть генетиком, чтобы это понять, но всё правда.
Теперь расскажу подробнее, чтобы всё прояснить.
Было обнаружено, что фрагмент ДНК длиной 50000 нуклеотидных пар провоцирует тяжелое протекание COVID-19. Это фрагмент ДНК стопроцентно является неандертальским, а не кроманьонским и не денисовским (О денисовцах я расскажу потом, это тоже наши предки.) А про фрагмент –доказано.
Потом обнаружилось ещё более интересное!
Неандертальские гены оказались ответственны не только за уязвимость к Covid-19, провоцируя более серьезную форму заболевания (включая смерть), но и за выживание при заболевании. Правда, при помощи другого генетического варианта, в другой хромосоме!
Это обнаружили в Институте эволюционной антропологии Макса Планка (Германия) и Каролинском институте (Швеция). Эта последовательность находится в 12-й хромосоме, также доставшаяся нам от неандертальцев, примерно на 22% снижает риск летального исхода. Интересно, что этот вариант встречается примерно у половины людей за пределами Африки.
Поразительно! Понимаете? Ведь два неандертальских гена действуют в противоположных направлениях!
Скорее всего, это связано с тем, что выявленный участок влияет на устойчивость к каким-то другим вирусам помимо нового коронавируса.
Как доказали, что эти последовательности неандертальские?
Оказалось, что почти все люди, за исключением коренных африканцев, в той или иной степени являются носителями неандертальских генов. Впервые эти последовательности нашли в геноме неандертальца из хорватской пещеры Виндия, потом проанализировали ДНК у 835 больных и 1255 здоровых итальянцев, а также у 775 больных и 950 здоровых испанцев и нашли эту же последовательность. В дальнейшем эти же последовательности обнаружили в нескольких независимых исследованиях на других европейских и азиатских популяциях людей.
Последовательность, приводящая к неблагоприятному исходу при заражении ковидом 19 была названа «аллель риска». Получение человеком от родителей этого «аллеля» в 1,6 раз повышает риск летального исхода с достоверностью 95%. Кстати, этот «аллель риска», был в два раза чаще у госпитализированных по сравнению с тем, кто болел дома.
В настоящее время эти последовательности встречается у 30% современных людей в Юго-Восточной Азии, почти всегда присутствует в Европе, но в Восточной Азии практически отсутствует. Почему так случилось? Никто не знает!
Теперь начинаются некие генетические сложности. У больных ковидом была обнаружена неравновесность по сцеплению, то есть существует достоверно выше встреча определенных сочетаний генов, чем случайное сочетание аллельных вариантов этих генов. Вот эти сочетания генов и были получены предками современных людей от неандертальцев в результате гибридизации.
Я когда это прочла, то сразу подумала, а как же рекомбинация?
Известно, что 80% изменчивости у людей определяется результатом рекомбинации, а не мутациями. Ответ один, такое может быть, только при наличии постоянной гибридизации кроманьонцев и неандертальцев в некоторых участках Европы, которая началась 60 тысяч лет назад, когда сапиенсы пришли в Европу из Африки.
Частота «аллеля риска» в современных человеческих популяциях сильно варьирует в зависимости от региона. Логично предположить, что главным фактором отбора сочетания определённых генов были какие-то патогены. Увы, пока все это только домыслы!
Теперь поговорим, о том, что находится в этой последовательности, длиной 50000 нуклеотидных пар.
Этот участок, расположенный в третьей хромосоме, включает гены: SLC6A20, LZTFL1, CCR9, FYCO1, CXCR6 и XCR1.
Ген SLC6A20 – кодирует белок, который, взаимодействует с белком ACE2 –«входными воротами» нового коронавируса. Гены CCR9 и CXCR6 и кодируют рецепторы хемокинов, причём работа второго из них имеет прямое отношение к иммунным процессам в лёгких человека при гриппе. Правда интересно?!
Когда-нибудь, мы узнаем, от каких патогенов защищал эта странная последовательность неандертальцев, но можно сказать наверняка, что в 2020 году с некоторыми нашими современниками неандертальское наследие сыграло злую шутку. Однако можно добавить, что прививки на основе носителя аденовируса, сыграли колоссальную роль при повышении шансов выживания. Как знать, может та последовательность, в 12 хромосоме, индуцировала в ответ на прививку факторы, снижающие тяжесть протекания процесса при заражении коронавирусом! Мы ведь так и не исследовали геномы тех, кто после прививок, плевали на заражение, отделываясь легким насморком!
Статей, посвящённых таким исследованиям, я не нашла. А ведь прививка, наша отечественная, спасла десятки тысяч людей! Более того, иммунитет, к новому, промутировавшему вирусу ковида, смог помочь выжить многим. Может пора заняться, наконец, молекулярной биологией этого заболевания и у нас в стране? Наши популяции ведь тоже несут гены неандертальцев!
