Собрание икон в музее сегодня насчитывает более трёхсот произведений иконописи, в основном Нового времени - XVII начала XX вв.
Следует подчеркнуть, что, несмотря на незначительное по количеству собрание икон музея, его памятники вполне отчетливо отражают основные - неоднозначные и противоречивые процессы и тенденции, присущие русскому иконописанию в эти столетия.
Экспозиция включает памятники, происходящие из традиционных древнерусских центров, произведения, созданные непосредственно в Сибири и на Урале, а также образцы позднего иконописания из Палеха и Мстёры.
Несомненным украшением зала является образ Спаса Нерукотворного, написанный в Сибири в начале XVII века мастерами, имевшими московскую выучку.
Главной своей покровительницей сибиряки считали икону Богоматери Абалакской, созданной в 1637 году новгородским иконником Матфеем Мартыновым. Многочисленные списки святыни разошлись по городам Сибири, один из них, написанный маслом во второй половине XIX столетия, представлен в экспозиции.
Кисти северных мастеров принадлежит несколько икон, украшающих экспозицию своей внутренней энергией, сказочностью трактовки сюжета. Таков образ Алексея Человека Божия и Александра Свирского, созданный в XVIII веке. Его отличают простые обобщенные формы чуть коренастых фигур святых, прочно стоящих, а не парящих над землей.
Ряд памятников конца XVII – начала XIX веков связан с московской школой. Это образ Богоматери Одигитрии, созданный в XVII веке с соблюдением всех древних канонов, яркая икона Богоматери Владимирской конца XVII столетия, принадлежащая к числу популярных в столице, «украшенных» образов Царицы Небесной, Троица Ветхозаветная с деяниями XIX века.
Барочные формы и принципы «живоподобия», органично сплавленные с традицией канона, определяют стиль двух икон XVIII столетия с изображением Святого князя Феодора Смоленского с сыновьями Давидом и Константином и Христа Великого Архиерея.
Старообрядческая иконопись представлена в экспозиции Владимиро-Суздальскими центрами – Мстерой, Палехом и Уральским - Невьянском. Примером многосюжетной и многофигурной композиции, выполненной палехским художником В.И. Хохловым в духе строгановских мастеров, является представленная в экспозиции икона «Суббота всех святых» 1830 года. Блестящее композиционное мастерство, точный «мелочный» рисунок, мастерское вохрение ликов плавями, колористическое богатство выделяют эту икону даже среди палехских образов. Это произведение по праву считается одним из лучших среди палехских образов.
Экспозиция призвана не только демонстрировать памятники древнерусской живописи из нашей коллекции, но представить духовную атмосферу, окружавшую томичей в прошлые века, которая и сегодня остается важной для многих русских православных семей.