Звезда «Острых козырьков» и «Оппенгеймера» встретил Ивонн МакГиннесс еще до того, как стал известным. Они познакомились в 1996 году, когда Ивонн пришла на один из концертов джаз-фанк-группы, в которой Киллиан пел и играл на гитаре. В то время он был студентом юридического факультета Ирландского национального университета в Корке и начинал покорять сцену со спектаклем «Дискосвиньи». Эта пьеса имела большой успех, после чего последовали 18-месячные гастроли, на которые МакГиннесс отправилась вместе с труппой как художница. «Она поехала с нами в турне. Это было так волнительно, двадцать лет назад или сколько бы это ни было – мы все были еще детьми, пытались найти свой путь, – но это было такое особенное, особенное время», – вспоминал актер. В 2001 году Киллиан и Ивонн переехали из Ирландии в Лондон, чтобы МакГиннесс могла продолжить образование в Королевском колледже искусств. В 2004-м пара сочеталась браком. По некоторым сведениям, церемония прошла на винограднике отца невесты в Провансе