Электричество играет ключевую роль в работе системы автономной канализации, обеспечивая жизнь множеству аэробных микроорганизмов. Без компрессора, работающего благодаря электричеству, аэробные микроорганизмы начнут погибать, а качество очистки значительно снизится. Длительное отключение электроэнергии приведет к тому, что система перейдет в режим септика, а необходимость перезапуска установки обойтись не удастся. Однако, кратковременные отключения не повлияют на работу станции, и восстановление микрофлоры потребует около месяца. Но сейчас появились новые модели которые могут продержаться до 9 часов без электричества.