Так бывает по тем или иным причинам, гипервизор перестает работать в штатном режиме и начинает глючить, а именно контрольные точки не удаляются и не объединяются в одну машину.
Для этого в Powershell нужно набрать всего лишь одну команду:
Get-VMSnapshot -VMName "VirtualMashine" | Remove-VMSnapshot
где "VirtualMashine" - это название вашей виртуальной машины в гипервизоре
