Путь главных героев игры
Осенью спустя несколько месяцев Джоэл и Элли находят Томми. Брат Джоэла вместе со своей женой Марией (Эшли Скотт) и несколькими другими семьями обустраивают поселение вокруг восстановленной гидроэлектростанции в округе Джексон, штат Вайоминг. На подаренной лошади герои добираются до Колорадского университета, где, по словам Томми, должна находиться лаборатория «Цикад». На месте оказывается, что университет заброшен, а лаборатория была эвакуирована в Солт-Лейк-Сити, штат Юта. Двое попадают в засаду бандитов, в результате которой Джоэл получает тяжёлое ранение.
Наступает зима, главные герои укрываются в горах, но Джоэл всё ещё находится в критическом состоянии. Элли, охотясь в заснеженном лесу, сталкивается с Дэвидом (Нолан Норт) и Джеймсом (Рубен Лэнгдон), у которых выменивает пенициллин на тушу оленя. Дэвид проявляет к Элли интерес и предлагает ей присоединиться к их группе, обосновавшейся в городке по соседству.
В разговоре выясняется, что новые знакомые Элли — каннибалы, и что именно с их группой Элли и Джоэл столкнулись в университете. Уводя преследователей от раненого Джоэла, она попадает в плен. Тем временем частично оправившийся от ран Джоэл отправляется на выручку. Элли пытается бежать, но оказывается загнанной Дэвидом в угол в горящем здании ресторана. Поспевший Джоэл находит Элли, безудержно наносящую удары мачете по Дэвиду. Он успокаивает подопечную и двое скрываются из городка.
Через некоторое время герои добираются до конечной точки своего путешествия — Солт-Лейк-Сити. В затопленных туннелях, наполненных толпой заражённых, на пути через город Джоэл и Элли едва не тонут, но их выручают «Цикады» под командованием Марлин, также добравшейся на запад из Бостона. Она сообщает Джоэлу, что для разработки вакцины врачам придётся извлечь кордицепс из мозга Элли, что гарантированно убьёт девочку. Джоэл с боем пробивается до операционной и забирает Элли. Марлин пытается договориться с ним, но главный герой убивает и её, полагая, что она попытается преследовать их.
По дороге из города Джоэл, пытаясь оправдаться, уверяет Элли, что она не единственный обладатель иммунитета, и что «Цикады» прекратили попытки создать вакцину. Неподалёку от поселения Томми Элли рассказывает Джоэлу о том, как её укусили, и просит его поклясться, что его история о «Цикадах» — правда. На что Джоэл отвечает: «Клянусь»