Пещера Святой Софии – одна из трёх одноименных на Кифире. Две другие расположены в Агии Пелагии и Каламосе, на самом деле по местным преданиям эти пещеры связаны друг с другом. Пещера Святой Софии Милопотамос на Кифире – первая, научно исследованная в Греции в 1930 году Патриархом греческой спелеологии Иоаннисом Петрохилосом и его женой Анной, родом из Кифиры. Пещера расположена на западном берегу, в бухте. Кости, и им 4 миллиона лет. Уже с 13 в. киферийцы превратили вестибюль пещеры в место церковного богослужения, украсив его житиями, изображающими фигуры святых в полный рост. Иностранные туристы, прибывшие на остров с 17 в. они улавливают в своих свидетельствах трепет, вызываемый этой темной пропастью земли. Внутри пещеры старые гравюры с именами и датами напоминают сегодняшнему посетителю, что ему предшествовали многие другие, такие как английский путешественник 1810 года, а также сами кифирийцы, которые искали убежища в пещере во время оккупации. Среди изображенных фиг