Официально известно, что актер был женат всего один раз на телеведущей Алисе Шер. В браке у них родился сын Кирилл, который пошел по стопам отца и сейчас вовсю развивает актерскую карьеру. После развода в 2010 году СМИ приписывали Нагиеву романы с певицей Жанной Фриске и владелицей фитнес-империи Ольгой Слуцкер, отношения с которыми актер отрицал. Более того, чтобы доказать отсутствие связи со Слуцкер, Дмитрий подал в суд на издание, которое распространяло слухи.
Среди женщин, с которыми Нагиеву приписывали романы в 2000-е, была теле- и радиоведущая Наталия Коваленко. В этот раз Дмитрий не опровергал слухи, но и не делал официальных заявлений об отношениях. Зато намек на их связь появился в книге «Я была женой Нагиева» экс-супруги актера Алисы Шер. В мемуарах она вскользь упомянула «подругу» актера, которая работала на радиостанции. Как раз там же была трудоустроена Коваленко.
Масла в огонь подливали СМИ, которые писали, что у Нагиева и Коваленко есть общий сын по имени Марк. Про внебрачного ребенка и роман с Наталией Дмитрий, как обычно, не распространялся. Но в декабре 2021 года в прямом эфире финала шоу «Голос» Нагиев неожиданно поздравил с днем рождения некого Марка. Стоит отметить, что его предполагаемый сын родился 30 декабря.
Редакция Super уверена: у актера действительно есть сын, которого зовут Марк Дмитриевич Нагиев. По мнению журналистов, мальчику 15 лет, он живет в Санкт-Петербурге, учится в школе и увлекается рисованием.
В свободное время Марк выжигает и рисует картины по дереву, которые также делает на заказ. Его большая страсть — коллекционирование фигурок героев известных фильмов. Кроме этого, как написано на одной из его страниц в запрещенной соцсети, он обожает морских свинок. Среди подписчиков Марка замечен директор актера и его старшего сына Кирилла Нагиева, а также Наталия Коваленко и ее мать.