Будущий епископ Стефан (в миру Валериан Степанович Бех) родился в 1872 г. в дворянской семье, окончил юридический факультет Санкт-Петербургского университета и Московскую духовную академию со степенью кандидата богословия. Духовным отцом Валериана Степановича был праведный Иоанн Кронштадтский.
В 1903 г. Валериан был пострижен в монашество с именем Стефан, рукоположен во иеродиакона, а в 1907 г. - во иеромонаха. Вплоть до революции отец Стефан трудился смотрителем в духовных училищах, в 1911 г. был возведен в сан архимандрита. В 1918 г. отец Стефан был зачислен в братию Александро-Невской лавры, в 1919 г. был арестован и провел в заключении несколько месяцев. После освобождения исполнял обязанности благочинного и духовника лавры. В 1921 г. архимандрит Стефан был рукоположен во епископа Ижевского Сарапульской епархии.
Созданный ГПУ обновленческий раскол епископ Стефан встретил резко отрицательно и вступил с ним в борьбу. В том же году архипастырь был арестован и приговорен к трехлетней