Недавнее исследование, проведенное Оксфордским университетом, показало, что значительная часть случаев заражения SARS-CoV-2 среди населения в целом может приводить к персистирующим инфекциям, которые длятся один месяц и более. Эти результаты были опубликованы в научном журнале Nature.
Долгое время считалось, что длительные инфекции COVID-19 среди людей с ослабленным иммунитетом могут быть причиной многочисленных новых вариантов, появившихся во время пандемии, и распространения последовательных волн инфекций, включая альфа- и омикронные варианты. Однако до сих пор распространенность длительного COVID-19 среди населения в целом, а также то, как вирус мутирует в этих случаях, оставались неизвестными.
Чтобы исследовать это, исследователи использовали данные опроса Covid-инфекции (CIS), проведенного Управлением национальной статистики (ONS). Участники этого опроса тестируются примерно каждый месяц, и из более чем 90 000 человек, принявших участие, 3603 сдали два или более положительных теста в период с ноября 2020 по август 2022 года. Из них 381 человек болел одной и той же вирусной инфекцией в течение одного месяца или более.
В этой группе у 54 человек была персистирующая инфекция, которая продолжалась не менее двух месяцев. По оценкам исследователей, от 0,1% до 0,5% всех инфекций могут стать персистирующими и длиться в течение 60 и более дней. В некоторых случаях люди остаются инфицированными вариантами вируса, которые вымерли среди населения в целом. Однако исследователи обнаружили, что повторное заражение тем же вариантом встречается очень редко, вероятно, из-за того, что у хозяина развивается иммунитет к этому конкретному варианту, а вирус снижается до очень низкого уровня через несколько месяцев.
Понимание вирусной динамики и длительного COVID
Из 381 случая персистирующей инфекции у 65 человек в течение болезни было проведено три или более ПЦР-тестов. У большинства (82%) из этих людей наблюдалась восстановительная вирусная динамика с пиками высокой и низкой вирусной нагрузки. По мнению исследователей, это указывает на то, что вирус сохраняет способность к активному размножению во время длительных инфекций.
В ходе исследования у людей с персистирующими инфекциями вероятность возникновения длительных симптомов COVID через 12 недель и более после начала заболевания была на 55% выше, чем у лиц с более типичными случаями. У некоторых индивидуумов выявлено чрезвычайно большое количество мутаций, в том числе тех, которые определяют новые варианты коронавируса и изменяют сайты-мишени для моноклональных антител. Эти мутации также вносят изменения в спайковый белок коронавируса. Однако у большинства людей нет большого количества этих мутаций, что позволяет предположить, что не каждая персистирующая инфекция может привести к появлению новых вызывающих беспокойство вариантов.
Соавтор исследования, доктор Махан Гафари (Pandemic Sciences Institute, Nuffield Department of Medicine, University of Oxford), сказал: "Наши наблюдения подчеркивают сохраняющуюся важность геномного надзора на уровне сообщества как для мониторинга появления и распространения новых вариантов, так и для получения фундаментального понимания естественной истории и эволюции новых патогенов и их клинических последствий для пациентов".
Соавтор исследования доктор Катрина Литго (Katrina Lythgoe) с биологического факультета университета сказала: "Хотя связь между персистенцией вируса и длительным COVID может быть не прямой, эти результаты свидетельствуют о том, что персистирующие инфекции могут способствовать основным патофизиологическим механизмам длительного COVID. Действительно, было предложено несколько других потенциальных механизмов, способствующих длительному развитию COVID, включая воспаление, повреждение органов и микротромбоз".
Первоисточник: “Prevalence of persistent SARS-CoV-2 in a large community surveillance study” by Mahan Ghafari, Matthew Hall, Tanya Golubchik, Daniel Ayoubkhani, Thomas House, George MacIntyre-Cockett, Helen R. Fryer, Laura Thomson, Anel Nurtay, Steven A. Kemp, Luca Ferretti, David Buck, Angie Green, Amy Trebes, Paolo Piazza, Lorne J. Lonie, Ruth Studley, Emma Rourke, Darren L. Smith, Matthew Bashton, Andrew Nelson, Matthew Crown, Clare McCann, Gregory R. Young, Rui Andre Nunes dos Santos, Zack Richards, Mohammad Adnan Tariq, Roberto Cahuantzi, Wellcome Sanger Institute COVID-19 Surveillance Team, COVID-19 Infection Survey Group, The COVID-19 Genomics UK (COG-UK) Consortium, Jeff Barrett, Christophe Fraser, David Bonsall, Ann Sarah Walker and Katrina Lythgoe, 21 February 2024, Nature.
DOI: 10.1038/s41586-024-07029-4