Здание Зоологического музея построено в 1896-1902 годах архитектором Константином Михайловичем Быковским, специально для нужд музея.
В декоративных элементах на фасаде здания используется анималистический и растительный мотивы.
В 1920‑е годы в здании разместили рабочие помещения Научно-исследовательского института зоологии.
Институт стал местом действия в фантастической повести Михаила Булгакова "Роковые яйца".