Британские генетики разработали метод анализа геномных данных cobraa для обнаружения древних событий разделения и слияния предковых популяций, пишет журнал «Элементы».
Исследование геномов современных людей показало, что 1,5 млн лет назад популяция разделилась на две части: A и B. Популяция A была изначально меньше, но затем увеличила численность. 0,3 млн лет назад A получила 20% генетической примеси от B, что привело к возникновению современного человечества (80% A 20% B). Популяции A и B приобрели генетическую несовместимость, но отбор удалил часть примесей B из важных участков генома, сохранив полезные гены нервной системы. Предки неандертальцев и денисовцев отделились до гибридизации.
Для анализа динамики численности популяции используется теория коалесценции. Метод оценивает времена схождения аллелей к общему предку для разных участков генома. Высокая частота коалесценции указывает на низкую численность, а низкая на высокую. Однако этот подход не различает демографические изменения и структуру популяции.
Генетики из Кембриджа предложили учитывать условное распределение времен коалесценции соседних участков генома. Это позволяет определить, было ли разделение популяции на изолированные части. Они разработали модель cobraa, которая реконструирует древние события разделения и гибридизации, анализируя генетические данные.