Екатерина Николаевна Фарафонова родилась в Твери в 1922 году. О ее семье и жизни в открытых источниках нет информации. Известно, что она хорошо училась, в 1937 году вступила в комсомол, а с 1939 по 1941 год работала лаборанткой на Калининском молочном заводе.
Войну встретила в Калинине, город покинула из-за оккупации. Участницей партизанского движения стала добровольно в апреле 1942 года. Входила вместе с Зинаидой Тимофеевой в отряд «За родную землю» 2-й Калининской партизанской бригады, общая численность которой составляла 178 человек.
Как следует из исторической справки комиссара бригады Александра Павловича Константинова, именно в апреле 1942 года из молодежи и комсомольцев разных, неоккупированных районов области, Калининский обком ВКП (б) создал три отряда, которые до июня 1942 года базировались в нейтральной зоне на территории Великолукского района Калининской области (ныне Псковская область) и действовали как самостоятельные, выходя для совершения операций за линию фро