Привет, у меня плохие новости, похоже нас ждут опасные приключения.
Обычный день в Бикини Боттом, но необычный день для Планктона. Отбросив попытки заполучить формулу Крабсбургера, Шелдон заинтересовался новой идеей, взломать секретную лабораторию по производству биологического оружия, главным из которых является: слизь "Нано Мутант", не имеющая аналогов из-за редких компонентов в составе. Воспользовавшись компьютером своей супруги Карен ему удалось получить необходимые данные системы и ограничить доступ к складу встроенным непреодолимым барьером. Осознав, что с помощью новейших технологий, он сможет получить неоспоримую власть, ему остаётся придумать, каким образом добраться до склада.
Вскоре лабораторные хакеры устанавливают личность злоумышленника (планктона) и по приказу руководства направляют своих агентов на его поиски. По прибытии из Бикини Готэм в Бикини Боттом они обнаруживают, что от Чам Баккета остался лишь круглый след, ведро при помощи катапультации сменило своё местонахождение. Блестящий ход, но обстоятельства оборачиваются неприятностью для Шелдона.
Время познакомиться с новой героиней фильма, племянницей планктона Салли. Салли, молодая девушка восемнадцати лет, учится на третьем курсе готэмского колледжа. Салли девушка с характером, время от времени ей в голову приходят безумные идеи, но она ограничивается лишь небольшими шалостями внутри учебного заведения, дабы не быть похожей на своего безумного дядю. Хакеры, узнав о Салли, по решению своего босса отправляют агентов, которые похищают её и отправляются на свою базу. Планктон, узнав о случившемся по видеосообщению, даёт понять, что это не станет помехой для достижения его цели, но Карен настаивает на том, чтобы он освободил её из заточения, ибо та очень дорога для неё.
Шелдон всё же соглашается отправиться на помощь племяннице. Ему приходит идея создать команду по спасению Салли, замышляя выставить их в качестве приманки и во время битвы добраться до "Нано Мутанта". Рассказав о "своём несчастии" Губки Бобу, они собирают команду, заманив в неë даже Сквидварда.
Красти Краб переходит в режим Корабль-ресторан на воде и на нём все они отправляются в далёкий Бикини Готэм.