19 апреля 2006 года ФГУП «Концерн Росэнергоатом» направил в правительство Ленинградской области декларацию о намерениях №06-2132, где сообщил о готовности в ближайшие восемь лет вложить в строительство замещающих мощностей ЛАЭС 85 млрд рублей.
17 мая 2006 года Ленинградскую АЭС посетили руководитель Федерального Агентства по атомной энергии Сергей Владиленович Кириенко, руководитель Ростехнадзора Константин Борисович Пуликовский, полномочный представитель Президента РФ по Северо-Западу Илья Иосифович Клебанов и губернатор Ленинградской области Валерий Павлович Сердюков.
В ходе совещания совместно с руководством ЛАЭС обсуждались вопросы работы энергоблоков и планы по строительству замещающих мощностей. Кроме того, высокие гости осмотрели площадку, на которой должно начаться строительство новых энергоблоков.
31 мая 2006 года межведомственная комиссия Ленинградской области по размещению производственных сил дала согласие на размещение новых мощностей первой очереди новой атомной станции на территории муниципального образования Сосновоборского городского округа, на землях, отведенных для сооружения Северо-Западного научно-промышленного центра атомной энергетики (генеральный застройщик — Концерн «Росэнергоатом», проектная организация — Санкт-Петербургский институт «Атомэнергопроект»).
17 июня 2006 года с начала эксплуатации энергоблоков ЛАЭС выработала рекордное среди АЭС России количество электроэнергии — 700 миллиардов киловатт-часов.
16 сентября 2006 года энергоблок №4 Ленинградской атомной станции был остановлен на капитальный планово-предупредительный ремонт.
11 октября 2006 года был завершен первый этап модернизации энергоблока №2 с целью продления срока его эксплуатации.
25 октября 2006 года Федеральному государственному унитарному предприятию «Российский государственный концерн по производству электрической и тепловой энергии на атомных станциях» были предложены в аренду расположенные в промышленной зоне г. Сосновый Бор земельные участки площадью 164848 и 111620 кв. метров под изыскательские работы для размещения замещающих мощностей Ленинградской АЭС.
В 2007 году на Ленинградской АЭС был сформирован отдел вывода из эксплуатации и новых блоков на базе отдела реконструкции и замещающих мощностей.
Первым начальником ОВЭНБ был назначен Романов Виктор Георгиевич.
В 2010 году, после создания Дирекции строящейся ЛАЭС-2, ОВЭНБ был преобразован в Отдел вывода из эксплуатации.
На протяжении существования отдела в нем работали специалисты высочайшей квалификации: Шапошников Владимир Андреевич, Полтараков Геннадий Иванович, Сырейщиков Владимир Александрович и др.
В феврале 2007 года в Сосновом Бору прошли общественные слушания по оценке воздействия на окружающую среду строительства и эксплуатации Ленинградской атомной станции-2. Участники слушаний (около 1000 человек) согласились с необходимостью строительства новой атомной станции.
29 апреля 2007 года после завершения планового капитального ремонта с заменой 528 технологических каналов реактора в сеть был включен турбогенератор №8 энергоблока №4 Ленинградской АЭС, остановленный 16 сентября 2006 г.
25 мая 2007 года губернатором Ленинградской области была образована комиссия по выбору земельного участка под размещение замещающих мощностей Ленинградской АЭС (энергоблоки №1 и №2).
Председателем комиссии назначили вице-губернатора Ленобласти Дваса Григория Викторовича. В состав комиссии вошли, помимо представителей органов государственной власти и Концерна «Росэнергоатом», представители власти г. Сосновый Бор и специалисты городской администрации.
29 мая 2007 года Ленинградскую АЭС посетили руководитель Ростехнадзора Константин Борисович Пуликовский и Генеральный директор Агентства по ядерной энергии Организации финансово-экономического сотрудничества и эволюции Луис Эчаварри.