Службу в органах Федеральной службы безопасности РФ начинал с должности оперуполномоченного.
Геннадий Борисович Анацкий родился 28 февраля 1970 года. Учился в Киевском институте инженеров гражданской авиации по специальности «авиационный инженер».
Службу в органах Федеральной службы безопасности РФ начинал с должности оперуполномоченного. Работал заместителем начальника УФСБ по Кабардино-Балкарии, курировал обеспечение экономической безопасности в регионе. С 2017 года занимал должность первого заместителя начальника УФСБ по Тюменской области, курировал борьбу с терроризмом и контрразведку.
22 сентября 2021 года назначен на должность начальника управления Федеральной службы безопасности РФ по Пермскому краю.
20 ноября 2023 года телеграм-канал brief сообщил, что генерал ФСБ Геннадий Анацкий назначен руководителем УФСБ по Дагестану.