Ключевым в жизни Яковлева стал 1953 год, когда его переводят в Москву (начало правления Хрущёва). Скорее всего, он уже тогда имел ценность для кукловодов, воздействующих на нового генсека.
Отработав 3 года на должности «инструктора ЦК КПСС», он с 1956 по 1959 гг. учился в «Академии общественных наук при ЦК КПСС», в т.ч. в 1958-1959 гг. прошёл стажировку в «Колумбийском университете» (США). Где его «научным руководителем» был ярый антикоммунист и политолог Дэвид Трумэн.
Это не помешало Яковлеву с 1960 по 1973 года работать в аппарате ЦК КПСС, попутно (с 1966 по 1973 гг.) входить в состав редколлегии журнала «Коммунист». В этом же журнале, позднее, работал и Гайдар.
После смещения Хрущёва совместными силами «днепропетровцев» и «шелепинцов», Яковлев приложил усилия, что бы «днепропетровцы», а не «шелепинцы» оказались у руля власти в СССР.
Суть дела: «шелепинцы» - в основном, выходцы из руководства ВЛКСМ конца 1940-х-1950-х гг. (времени сталинской «борьбы с космополитизмом»). Их лидер А. Шелепин в 1952 году был назначен И. Сталиным руководить Комсомолом, а позднее занял пост председателя КГБ. Данная группа хотела вернуться к сталинской системе управления, с её «великодержавием» и антисемитизмом. У «днепропетровцев» лидером был уже не молодой Брежнев (58 лет) и данная группа была против реабилитации сталинизма, придерживаясь более умеренной «стабилизации».
Для «МФК» была более желанна группа Брежнева (меньшее из зол). Поэтому до решающего «Пленума ЦК КПСС» в 1967 г. Яковлев сделал всё возможное, что бы дискредитировать «шелепинцев», и помочь победе «брежневцев». Позднее, в 1972 г. он активно участвовал и в кампании направленной против национализма. На самом деле она была нужна, чтобы лишились своих должностей в «Политбюро» Г. Воронова, П. Шелеста и В. Мжеванадзе, представлявшие разные (русский, украинский и грузинский) направления национализма. Что, в свою очередь, облегчило посадку СССР на «нефтяную иглу».
Яковлев пытался оставить у власти Дубчека – главного организатора «Пражской весны» 1968 г. (в 1989 г. тот организовывал «Бархатную революцию» в Чехословакии).
В конце 1960-х — начале 1970-х годов выступал за развитие в СССР социологии, с 1984 года начал свою вредоносную деятельность в качестве депутата «Верховного совета».
В это же время Яковлев стал директором «Института мировой экономики и международных отношений». Данный институт (тогда он назывался ИМХиМП), был образован в 1925 г. (в этот период «МФК» начали поддерживать Сталина), а в 1947 г. власти его закрыли, никому ничего не объясняя (т.е. для этого были очень серьёзные основания, не подлежащие разглашению).
Но как только в генсеки пропихнули Хрущёва, в 1956 г. институт возродили. Причиной такой настойчивости «МФК» является то, что данный институт разрабатывает аналитические основы для принятия политических и экономических решений руководством страны. К прим., в период руководства Яковлева (1983—1985) институтом была направлена записка в ЦК КПСС о целесообразности создания в СССР предприятий с участием иностранного капитала.
В 1986 году Яковлев стал секретарём ЦК КПСС и влияя на вопросы идеологии и информации, выступал за всемерное развитие связей с западными странами. Принимал самое активное участие в разработке и реализации экономических и политических реформ в СССР.
Как мог способствовал публикации в СССР произведений Набокова, Солженицына и др. подобных писак, помог выходу на экраны около 30 ранее запрещённых фильмов. Так же Яколев был инициатором решения «Политбюро ЦК КПСС» (в мае 1988 года) об издании в стране ранее запрещённых трудов некоторых философов. Всячески способствовал восстановлению отношений между правительством и РПЦ (это было нужно для борьбы с коммунистами).
В 1987 году принимал активное участие в чистке советского генералитета, используя в качестве предлога «полёт Руста». Пропихивал на пост министра обороны Язова, рекомендовал назначить Крючкова председателем КГБ.
Возглавил комиссию, подготовившую резолюцию «О гласности». В августе 1988 года совершил визит в Латвийскую ССР, где одобрил и поддержал деятельность местных властей и неформальных организаций. На сентябрьском (1988 г.) Пленуме ЦК КПСС ему было поручено курировать от ЦК КПСС внешнюю политику СССР, как результат – развал «Варшавского Договора».
В декабре 1989 года Яковлев сделал доклад, в котором страна впервые признавала наличие секретных протоколов к «пакту Молотова-Риббентропа». Позднее, в 1994 г., Яковлев стал членом «Комиссии по рассекречиванию документов». Возглавлял фонд «Демократия» (Фонд Александра Н. Яковлева), в котором подготовил к печати тома исторических документов, главным образом о сталинских репрессиях и деятельности ВЧК—ОГПУ—НКВД—КГБ.
После роспуска «Президентского совета» был назначен старшим советником президента СССР, но подал в отставку с этого поста 29 июля 1991 года – с одной стороны, чтобы не быть в числе «путчистов», с другой – настало время дистанцироваться от сыгравшего свою роль Горбачёва.
В июле 1991 года Яковлев, вместе с Шеварднадзе, создал «Движение демократических реформ». В конце сентября 1991 года был назначен «Государственным советником по особым поручениям» и членом «Политического консультативного совета при президенте СССР».
С января 1992 года занимал должность вице-президента «Горбачёв-Фонда». В 1993—1995 годах — руководитель «Федеральной службы по телевидению и радиовещанию» и председатель телерадиокомпании «Останкино». С 1995 по 1998 год — председатель Совета директоров ЗАО «Общественное российское телевидение».
В 2004-2005 гг. вошёл в состав «Комитета-2008: Свободный выбор» и «Открытая Россия», отметился в «Международном фонде милосердия» и «Лонардо-клуб». В 2005 году не постеснялся подписать открытое письмо, в котором призывал международное правозащитное сообщество признать олигарха Ходорковского, политическим заключённым.
Естественно, что Яковлев постоянно призывал к осуждению большевистского режима и резко выступал против антисемитизма.